Protein–RNA interactions for Protein: P53847

DSL1, Protein transport protein DSL1, yeast

Predictions only

Length 754 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DSL1	P53847	ENV9	YOR246C	993 nt		6.01	□□□□□ -1.45
DSL1	P53847	EEB1	YPL095C	1371 nt		6.01	□□□□□ -1.45
DSL1	P53847	GPD1	YDL022W	1176 nt		6	□□□□□ -1.45
DSL1	P53847	GTO3	YMR251W	1101 nt		6	□□□□□ -1.45
DSL1	P53847	MSO1	YNR049C	633 nt		6	□□□□□ -1.45
DSL1	P53847	MAL11	YGR289C	1851 nt		5.99	□□□□□ -1.45
DSL1	P53847	YFR052C-A	YFR052C-A	306 nt		5.99	□□□□□ -1.45
DSL1	P53847	YHR070C-A	YHR070C-A	411 nt		5.99	□□□□□ -1.45
DSL1	P53847	FOB1	YDR110W	1701 nt		5.99	□□□□□ -1.45
DSL1	P53847	VTH1	YIL173W	4650 nt		5.99	□□□□□ -1.45
DSL1	P53847	VTH2	YJL222W	4650 nt		5.99	□□□□□ -1.45
DSL1	P53847	YDL023C	YDL023C	321 nt		5.98	□□□□□ -1.45
DSL1	P53847	TMT1	YER175C	900 nt		5.98	□□□□□ -1.45
DSL1	P53847	NRM1	YNR009W	750 nt		5.98	□□□□□ -1.45
DSL1	P53847	PTC4	YBR125C	1182 nt		5.98	□□□□□ -1.45
DSL1	P53847	UTP4	YDR324C	2331 nt		5.98	□□□□□ -1.45
DSL1	P53847	BIO3	YNR058W	1443 nt		5.98	□□□□□ -1.45
DSL1	P53847	NPL6	YMR091C	1308 nt		5.98	□□□□□ -1.45
DSL1	P53847	ELP3	YPL086C	1674 nt		5.98	□□□□□ -1.45
DSL1	P53847	PET112	YBL080C	1626 nt		5.97	□□□□□ -1.45
DSL1	P53847	MRPL35	YDR322W	1104 nt		5.97	□□□□□ -1.45
DSL1	P53847	LCL3	YGL085W	825 nt		5.97	□□□□□ -1.45
DSL1	P53847	snR32	snR32	188 nt		5.97	□□□□□ -1.45
DSL1	P53847	IFA38	YBR159W	1044 nt		5.97	□□□□□ -1.45
DSL1	P53847	MNN5	YJL186W	1761 nt		5.97	□□□□□ -1.45
DSL1	P53847	RGT1	YKL038W	3513 nt		5.97	□□□□□ -1.45
DSL1	P53847	ORM1	YGR038W	669 nt		5.96	□□□□□ -1.46
DSL1	P53847	OM45	YIL136W	1182 nt		5.96	□□□□□ -1.46
DSL1	P53847	TIF2	YJL138C	1188 nt		5.96	□□□□□ -1.46
DSL1	P53847	TIF1	YKR059W	1188 nt		5.96	□□□□□ -1.46
DSL1	P53847	YML083C	YML083C	1257 nt		5.96	□□□□□ -1.46
DSL1	P53847	SEC17	YBL050W	879 nt		5.96	□□□□□ -1.46
DSL1	P53847	MRPS18	YNL306W	654 nt		5.96	□□□□□ -1.46
DSL1	P53847	PDB1	YBR221C	1101 nt		5.96	□□□□□ -1.46
DSL1	P53847	PTC3	YBL056W	1407 nt		5.96	□□□□□ -1.46
DSL1	P53847	EPS1	YIL005W	2106 nt		5.96	□□□□□ -1.46
DSL1	P53847	CLP1	YOR250C	1338 nt		5.96	□□□□□ -1.46
DSL1	P53847	RAD53	YPL153C	2466 nt		5.96	□□□□□ -1.46
DSL1	P53847	MDH3	YDL078C	1032 nt		5.95	□□□□□ -1.46
DSL1	P53847	YKL223W	YKL223W	333 nt		5.95	□□□□□ -1.46
DSL1	P53847	TRP3	YKL211C	1455 nt		5.95	□□□□□ -1.46
DSL1	P53847	GSY2	YLR258W	2118 nt		5.95	□□□□□ -1.46
DSL1	P53847	MPH3	YJR160C	1809 nt		5.95	□□□□□ -1.46
DSL1	P53847	AMD2	YDR242W	1650 nt		5.94	□□□□□ -1.46
DSL1	P53847	MHT1	YLL062C	975 nt		5.94	□□□□□ -1.46
DSL1	P53847	BUD14	YAR014C	2130 nt		5.94	□□□□□ -1.46
DSL1	P53847	RPS3	YNL178W	723 nt		5.94	□□□□□ -1.46
DSL1	P53847	SCO2	YBR024W	906 nt		5.94	□□□□□ -1.46
DSL1	P53847	SAL1	YNL083W	1485 nt		5.94	□□□□□ -1.46
DSL1	P53847	CYS4	YGR155W	1524 nt		5.94	□□□□□ -1.46
DSL1	P53847	ILV1	YER086W	1731 nt		5.94	□□□□□ -1.46
DSL1	P53847	YAP1801	YHR161C	1914 nt		5.93	□□□□□ -1.46
DSL1	P53847	YMR155W	YMR155W	1644 nt		5.93	□□□□□ -1.46
DSL1	P53847	BUG1	YDL099W	1026 nt		5.93	□□□□□ -1.46
DSL1	P53847	RPT3	YDR394W	1287 nt		5.93	□□□□□ -1.46
DSL1	P53847	GCG1	YER163C	699 nt		5.93	□□□□□ -1.46
DSL1	P53847	YJL193W	YJL193W	1209 nt		5.93	□□□□□ -1.46
DSL1	P53847	FPR3	YML074C	1236 nt		5.93	□□□□□ -1.46
DSL1	P53847	PLB3	YOL011W	2061 nt		5.93	□□□□□ -1.46
DSL1	P53847	TAX4	YJL083W	1815 nt		5.92	□□□□□ -1.46
DSL1	P53847	HOS1	YPR068C	1413 nt		5.92	□□□□□ -1.46
DSL1	P53847	CHO1	YER026C	831 nt		5.92	□□□□□ -1.46
DSL1	P53847	YJR084W	YJR084W	1272 nt		5.92	□□□□□ -1.46
DSL1	P53847	OST3	YOR085W	1053 nt		5.92	□□□□□ -1.46
DSL1	P53847	RBA50	YDR527W	1320 nt		5.92	□□□□□ -1.46
DSL1	P53847	GPD2	YOL059W	1323 nt		5.92	□□□□□ -1.46
DSL1	P53847	SIT1	YEL065W	1887 nt		5.92	□□□□□ -1.46
DSL1	P53847	CNE1	YAL058W	1509 nt		5.91	□□□□□ -1.46
DSL1	P53847	BCY1	YIL033C	1251 nt		5.91	□□□□□ -1.46
DSL1	P53847	VMA4	YOR332W	702 nt		5.91	□□□□□ -1.46
DSL1	P53847	PZF1	YPR186C	1290 nt		5.91	□□□□□ -1.46
DSL1	P53847	RPO26	YPR187W	468 nt		5.91	□□□□□ -1.46
DSL1	P53847	VRP1	YLR337C	2454 nt		5.9	□□□□□ -1.46
DSL1	P53847	SEC18	YBR080C	2277 nt		5.9	□□□□□ -1.46
DSL1	P53847	PHO86	YJL117W	936 nt		5.9	□□□□□ -1.46
DSL1	P53847	URA1	YKL216W	945 nt		5.9	□□□□□ -1.46
DSL1	P53847	YMR119W-A	YMR119W-A	375 nt		5.9	□□□□□ -1.46
DSL1	P53847	YNL067W-A	YNL067W-A	147 nt		5.9	□□□□□ -1.46
DSL1	P53847	DAP1	YPL170W	459 nt		5.9	□□□□□ -1.46
DSL1	P53847	YLL067C	YLL067C	3618 nt		5.9	□□□□□ -1.47
DSL1	P53847	ERG8	YMR220W	1356 nt		5.9	□□□□□ -1.47
DSL1	P53847	YTP1	YNL237W	1380 nt		5.9	□□□□□ -1.47
DSL1	P53847	CLB1	YGR108W	1416 nt		5.9	□□□□□ -1.47
DSL1	P53847	MCH1	YDL054C	1461 nt		5.9	□□□□□ -1.47
DSL1	P53847	ABZ1	YNR033W	2364 nt		5.89	□□□□□ -1.47
DSL1	P53847	ACS2	YLR153C	2052 nt		5.89	□□□□□ -1.47
DSL1	P53847	YCK1	YHR135C	1617 nt		5.89	□□□□□ -1.47
DSL1	P53847	PHM8	YER037W	966 nt		5.89	□□□□□ -1.47
DSL1	P53847	PDR16	YNL231C	1056 nt		5.89	□□□□□ -1.47
DSL1	P53847	ARO7	YPR060C	771 nt		5.89	□□□□□ -1.47
DSL1	P53847	ACC1	YNR016C	6702 nt		5.89	□□□□□ -1.47
DSL1	P53847	TBF1	YPL128C	1689 nt		5.88	□□□□□ -1.47
DSL1	P53847	YHR145C	YHR145C	357 nt		5.88	□□□□□ -1.47
DSL1	P53847	YKR045C	YKR045C	552 nt		5.88	□□□□□ -1.47
DSL1	P53847	POR1	YNL055C	852 nt		5.88	□□□□□ -1.47
DSL1	P53847	UIP5	YKR044W	1332 nt		5.88	□□□□□ -1.47
DSL1	P53847	ZWF1	YNL241C	1518 nt		5.88	□□□□□ -1.47
DSL1	P53847	RIM101	YHL027W	1878 nt		5.88	□□□□□ -1.47
DSL1	P53847	ARP1	YHR129C	1155 nt		5.87	□□□□□ -1.47
DSL1	P53847	RPE1	YJL121C	717 nt		5.87	□□□□□ -1.47

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