Protein–RNA interactions for Protein: P51809

VAMP7, Vesicle-associated membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP7P51809 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VAMP7P51809 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VAMP7P51809 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VAMP7P51809 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VAMP7P51809 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VAMP7P51809 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VAMP7P51809 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VAMP7P51809 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VAMP7P51809 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VAMP7P51809 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
VAMP7P51809 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
VAMP7P51809 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VAMP7P51809 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
VAMP7P51809 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VAMP7P51809 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VAMP7P51809 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VAMP7P51809 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VAMP7P51809 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VAMP7P51809 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VAMP7P51809 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VAMP7P51809 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VAMP7P51809 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VAMP7P51809 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VAMP7P51809 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VAMP7P51809 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
VAMP7P51809 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VAMP7P51809 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VAMP7P51809 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VAMP7P51809 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VAMP7P51809 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VAMP7P51809 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VAMP7P51809 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VAMP7P51809 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VAMP7P51809 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VAMP7P51809 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VAMP7P51809 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VAMP7P51809 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VAMP7P51809 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VAMP7P51809 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VAMP7P51809 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VAMP7P51809 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VAMP7P51809 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VAMP7P51809 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VAMP7P51809 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
VAMP7P51809 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VAMP7P51809 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
VAMP7P51809 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
VAMP7P51809 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
VAMP7P51809 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
VAMP7P51809 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VAMP7P51809 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VAMP7P51809 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VAMP7P51809 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VAMP7P51809 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VAMP7P51809 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VAMP7P51809 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VAMP7P51809 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
VAMP7P51809 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VAMP7P51809 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VAMP7P51809 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VAMP7P51809 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VAMP7P51809 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
VAMP7P51809 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VAMP7P51809 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VAMP7P51809 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VAMP7P51809 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
VAMP7P51809 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VAMP7P51809 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VAMP7P51809 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VAMP7P51809 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VAMP7P51809 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VAMP7P51809 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VAMP7P51809 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VAMP7P51809 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VAMP7P51809 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VAMP7P51809 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VAMP7P51809 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VAMP7P51809 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VAMP7P51809 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VAMP7P51809 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VAMP7P51809 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VAMP7P51809 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VAMP7P51809 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VAMP7P51809 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VAMP7P51809 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VAMP7P51809 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VAMP7P51809 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VAMP7P51809 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
VAMP7P51809 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VAMP7P51809 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VAMP7P51809 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VAMP7P51809 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VAMP7P51809 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
VAMP7P51809 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VAMP7P51809 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VAMP7P51809 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VAMP7P51809 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VAMP7P51809 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VAMP7P51809 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VAMP7P51809 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms