Protein–RNA interactions for Protein: P51784

USP11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11P51784 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP11P51784 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
USP11P51784 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP11P51784 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP11P51784 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP11P51784 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP11P51784 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP11P51784 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP11P51784 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP11P51784 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP11P51784 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP11P51784 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP11P51784 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP11P51784 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP11P51784 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
USP11P51784 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP11P51784 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP11P51784 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP11P51784 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP11P51784 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
USP11P51784 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
USP11P51784 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
USP11P51784 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP11P51784 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP11P51784 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP11P51784 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP11P51784 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP11P51784 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP11P51784 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP11P51784 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP11P51784 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP11P51784 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
USP11P51784 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP11P51784 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP11P51784 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
USP11P51784 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP11P51784 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
USP11P51784 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP11P51784 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP11P51784 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP11P51784 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP11P51784 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP11P51784 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP11P51784 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP11P51784 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP11P51784 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP11P51784 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP11P51784 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP11P51784 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP11P51784 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP11P51784 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP11P51784 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP11P51784 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP11P51784 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP11P51784 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP11P51784 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP11P51784 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP11P51784 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP11P51784 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP11P51784 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP11P51784 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP11P51784 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP11P51784 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP11P51784 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP11P51784 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP11P51784 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP11P51784 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP11P51784 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP11P51784 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
USP11P51784 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
USP11P51784 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP11P51784 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP11P51784 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP11P51784 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP11P51784 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP11P51784 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP11P51784 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP11P51784 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP11P51784 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP11P51784 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP11P51784 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP11P51784 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP11P51784 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP11P51784 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP11P51784 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP11P51784 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP11P51784 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP11P51784 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP11P51784 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP11P51784 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP11P51784 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP11P51784 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP11P51784 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP11P51784 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP11P51784 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP11P51784 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP11P51784 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP11P51784 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP11P51784 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
USP11P51784 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms