Protein–RNA interactions for Protein: P49788

RARRES1, Retinoic acid receptor responder protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES1P49788 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RARRES1P49788 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RARRES1P49788 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RARRES1P49788 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RARRES1P49788 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RARRES1P49788 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
RARRES1P49788 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
RARRES1P49788 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RARRES1P49788 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RARRES1P49788 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RARRES1P49788 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RARRES1P49788 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RARRES1P49788 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RARRES1P49788 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RARRES1P49788 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RARRES1P49788 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RARRES1P49788 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RARRES1P49788 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RARRES1P49788 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RARRES1P49788 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RARRES1P49788 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
RARRES1P49788 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
RARRES1P49788 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RARRES1P49788 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RARRES1P49788 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RARRES1P49788 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RARRES1P49788 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RARRES1P49788 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RARRES1P49788 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RARRES1P49788 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RARRES1P49788 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
RARRES1P49788 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RARRES1P49788 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
RARRES1P49788 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RARRES1P49788 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RARRES1P49788 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RARRES1P49788 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RARRES1P49788 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RARRES1P49788 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RARRES1P49788 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RARRES1P49788 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RARRES1P49788 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RARRES1P49788 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RARRES1P49788 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RARRES1P49788 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RARRES1P49788 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RARRES1P49788 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RARRES1P49788 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RARRES1P49788 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RARRES1P49788 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RARRES1P49788 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RARRES1P49788 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
RARRES1P49788 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RARRES1P49788 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RARRES1P49788 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RARRES1P49788 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RARRES1P49788 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RARRES1P49788 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RARRES1P49788 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RARRES1P49788 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RARRES1P49788 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RARRES1P49788 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RARRES1P49788 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RARRES1P49788 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RARRES1P49788 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RARRES1P49788 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RARRES1P49788 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RARRES1P49788 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RARRES1P49788 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RARRES1P49788 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RARRES1P49788 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RARRES1P49788 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RARRES1P49788 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RARRES1P49788 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RARRES1P49788 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RARRES1P49788 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RARRES1P49788 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
RARRES1P49788 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RARRES1P49788 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RARRES1P49788 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RARRES1P49788 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RARRES1P49788 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RARRES1P49788 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RARRES1P49788 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RARRES1P49788 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RARRES1P49788 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RARRES1P49788 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RARRES1P49788 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RARRES1P49788 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RARRES1P49788 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RARRES1P49788 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RARRES1P49788 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RARRES1P49788 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
RARRES1P49788 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RARRES1P49788 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
RARRES1P49788 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RARRES1P49788 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RARRES1P49788 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RARRES1P49788 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RARRES1P49788 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms