Protein–RNA interactions for Protein: P49760

CLK2, Dual specificity protein kinase CLK2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK2P49760 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLK2P49760 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CLK2P49760 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLK2P49760 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLK2P49760 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLK2P49760 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLK2P49760 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLK2P49760 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLK2P49760 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLK2P49760 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLK2P49760 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLK2P49760 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CLK2P49760 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLK2P49760 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLK2P49760 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
CLK2P49760 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLK2P49760 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLK2P49760 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLK2P49760 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLK2P49760 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLK2P49760 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLK2P49760 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLK2P49760 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CLK2P49760 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CLK2P49760 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLK2P49760 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLK2P49760 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLK2P49760 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLK2P49760 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CLK2P49760 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLK2P49760 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CLK2P49760 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLK2P49760 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLK2P49760 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLK2P49760 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLK2P49760 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLK2P49760 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLK2P49760 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLK2P49760 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLK2P49760 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLK2P49760 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLK2P49760 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLK2P49760 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLK2P49760 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CLK2P49760 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLK2P49760 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLK2P49760 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CLK2P49760 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLK2P49760 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLK2P49760 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLK2P49760 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLK2P49760 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLK2P49760 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLK2P49760 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLK2P49760 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLK2P49760 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLK2P49760 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLK2P49760 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLK2P49760 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLK2P49760 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLK2P49760 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLK2P49760 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLK2P49760 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLK2P49760 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLK2P49760 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLK2P49760 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLK2P49760 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLK2P49760 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLK2P49760 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLK2P49760 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLK2P49760 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLK2P49760 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CLK2P49760 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLK2P49760 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLK2P49760 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLK2P49760 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLK2P49760 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLK2P49760 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLK2P49760 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLK2P49760 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLK2P49760 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLK2P49760 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLK2P49760 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLK2P49760 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLK2P49760 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLK2P49760 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLK2P49760 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLK2P49760 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CLK2P49760 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CLK2P49760 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLK2P49760 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLK2P49760 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLK2P49760 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLK2P49760 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLK2P49760 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLK2P49760 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLK2P49760 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLK2P49760 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLK2P49760 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLK2P49760 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms