Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FNTAP49354 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FNTAP49354 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FNTAP49354 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FNTAP49354 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FNTAP49354 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FNTAP49354 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FNTAP49354 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FNTAP49354 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FNTAP49354 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FNTAP49354 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FNTAP49354 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
FNTAP49354 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FNTAP49354 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
FNTAP49354 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FNTAP49354 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FNTAP49354 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FNTAP49354 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FNTAP49354 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FNTAP49354 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FNTAP49354 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
FNTAP49354 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FNTAP49354 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FNTAP49354 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FNTAP49354 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FNTAP49354 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FNTAP49354 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FNTAP49354 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FNTAP49354 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FNTAP49354 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FNTAP49354 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FNTAP49354 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FNTAP49354 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FNTAP49354 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FNTAP49354 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FNTAP49354 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FNTAP49354 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
FNTAP49354 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FNTAP49354 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FNTAP49354 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
FNTAP49354 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FNTAP49354 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FNTAP49354 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FNTAP49354 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FNTAP49354 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FNTAP49354 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FNTAP49354 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FNTAP49354 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FNTAP49354 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FNTAP49354 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FNTAP49354 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FNTAP49354 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FNTAP49354 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FNTAP49354 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FNTAP49354 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FNTAP49354 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FNTAP49354 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FNTAP49354 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FNTAP49354 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FNTAP49354 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FNTAP49354 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FNTAP49354 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FNTAP49354 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FNTAP49354 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FNTAP49354 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
FNTAP49354 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FNTAP49354 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FNTAP49354 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FNTAP49354 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FNTAP49354 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FNTAP49354 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FNTAP49354 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FNTAP49354 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FNTAP49354 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FNTAP49354 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FNTAP49354 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FNTAP49354 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FNTAP49354 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FNTAP49354 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FNTAP49354 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FNTAP49354 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FNTAP49354 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FNTAP49354 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
FNTAP49354 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FNTAP49354 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FNTAP49354 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FNTAP49354 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
FNTAP49354 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
FNTAP49354 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FNTAP49354 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FNTAP49354 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FNTAP49354 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FNTAP49354 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FNTAP49354 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FNTAP49354 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FNTAP49354 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FNTAP49354 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FNTAP49354 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
FNTAP49354 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FNTAP49354 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms