Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRPC1P48995 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRPC1P48995 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRPC1P48995 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRPC1P48995 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRPC1P48995 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRPC1P48995 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRPC1P48995 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRPC1P48995 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRPC1P48995 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRPC1P48995 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRPC1P48995 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRPC1P48995 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRPC1P48995 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRPC1P48995 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRPC1P48995 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRPC1P48995 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRPC1P48995 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRPC1P48995 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRPC1P48995 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRPC1P48995 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRPC1P48995 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRPC1P48995 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRPC1P48995 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPC1P48995 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPC1P48995 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPC1P48995 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPC1P48995 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPC1P48995 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPC1P48995 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPC1P48995 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPC1P48995 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPC1P48995 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPC1P48995 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPC1P48995 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPC1P48995 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRPC1P48995 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRPC1P48995 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRPC1P48995 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRPC1P48995 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRPC1P48995 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRPC1P48995 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPC1P48995 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPC1P48995 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPC1P48995 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPC1P48995 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPC1P48995 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPC1P48995 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPC1P48995 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPC1P48995 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPC1P48995 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRPC1P48995 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPC1P48995 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPC1P48995 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPC1P48995 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPC1P48995 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPC1P48995 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPC1P48995 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPC1P48995 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPC1P48995 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPC1P48995 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPC1P48995 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPC1P48995 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPC1P48995 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPC1P48995 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPC1P48995 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPC1P48995 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRPC1P48995 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRPC1P48995 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRPC1P48995 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRPC1P48995 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRPC1P48995 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRPC1P48995 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRPC1P48995 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRPC1P48995 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRPC1P48995 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRPC1P48995 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRPC1P48995 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRPC1P48995 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRPC1P48995 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRPC1P48995 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRPC1P48995 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRPC1P48995 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRPC1P48995 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRPC1P48995 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRPC1P48995 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRPC1P48995 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRPC1P48995 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRPC1P48995 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRPC1P48995 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRPC1P48995 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRPC1P48995 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TRPC1P48995 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRPC1P48995 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRPC1P48995 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRPC1P48995 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRPC1P48995 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRPC1P48995 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRPC1P48995 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRPC1P48995 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.5 ms