Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT6CP48668 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT6CP48668 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT6CP48668 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT6CP48668 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT6CP48668 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT6CP48668 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT6CP48668 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT6CP48668 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT6CP48668 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT6CP48668 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT6CP48668 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT6CP48668 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT6CP48668 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT6CP48668 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT6CP48668 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT6CP48668 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT6CP48668 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT6CP48668 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT6CP48668 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT6CP48668 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT6CP48668 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT6CP48668 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT6CP48668 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT6CP48668 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT6CP48668 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT6CP48668 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT6CP48668 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT6CP48668 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT6CP48668 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT6CP48668 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT6CP48668 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT6CP48668 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT6CP48668 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT6CP48668 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT6CP48668 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT6CP48668 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KRT6CP48668 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT6CP48668 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT6CP48668 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT6CP48668 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT6CP48668 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT6CP48668 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT6CP48668 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT6CP48668 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT6CP48668 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT6CP48668 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT6CP48668 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT6CP48668 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT6CP48668 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT6CP48668 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT6CP48668 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT6CP48668 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT6CP48668 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT6CP48668 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT6CP48668 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT6CP48668 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT6CP48668 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT6CP48668 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT6CP48668 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT6CP48668 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT6CP48668 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT6CP48668 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT6CP48668 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT6CP48668 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT6CP48668 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT6CP48668 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT6CP48668 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT6CP48668 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT6CP48668 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT6CP48668 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
KRT6CP48668 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT6CP48668 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT6CP48668 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT6CP48668 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT6CP48668 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT6CP48668 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT6CP48668 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT6CP48668 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT6CP48668 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT6CP48668 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT6CP48668 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT6CP48668 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT6CP48668 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT6CP48668 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT6CP48668 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT6CP48668 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT6CP48668 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT6CP48668 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT6CP48668 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT6CP48668 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT6CP48668 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT6CP48668 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT6CP48668 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT6CP48668 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT6CP48668 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT6CP48668 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT6CP48668 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT6CP48668 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT6CP48668 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms