Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GCLMP48507 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GCLMP48507 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GCLMP48507 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GCLMP48507 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GCLMP48507 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GCLMP48507 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
GCLMP48507 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GCLMP48507 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
GCLMP48507 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GCLMP48507 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GCLMP48507 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GCLMP48507 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GCLMP48507 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GCLMP48507 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GCLMP48507 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
GCLMP48507 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GCLMP48507 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GCLMP48507 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GCLMP48507 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GCLMP48507 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GCLMP48507 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GCLMP48507 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GCLMP48507 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GCLMP48507 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GCLMP48507 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GCLMP48507 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GCLMP48507 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GCLMP48507 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GCLMP48507 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GCLMP48507 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
GCLMP48507 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GCLMP48507 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GCLMP48507 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GCLMP48507 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GCLMP48507 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GCLMP48507 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GCLMP48507 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GCLMP48507 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GCLMP48507 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GCLMP48507 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GCLMP48507 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GCLMP48507 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
GCLMP48507 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
GCLMP48507 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GCLMP48507 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GCLMP48507 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GCLMP48507 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GCLMP48507 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GCLMP48507 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GCLMP48507 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
GCLMP48507 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GCLMP48507 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
GCLMP48507 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GCLMP48507 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
GCLMP48507 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GCLMP48507 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GCLMP48507 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GCLMP48507 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GCLMP48507 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GCLMP48507 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GCLMP48507 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GCLMP48507 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GCLMP48507 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GCLMP48507 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GCLMP48507 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GCLMP48507 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GCLMP48507 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GCLMP48507 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GCLMP48507 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GCLMP48507 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
GCLMP48507 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GCLMP48507 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GCLMP48507 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GCLMP48507 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GCLMP48507 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GCLMP48507 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GCLMP48507 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GCLMP48507 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GCLMP48507 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GCLMP48507 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GCLMP48507 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GCLMP48507 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GCLMP48507 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GCLMP48507 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GCLMP48507 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GCLMP48507 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GCLMP48507 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GCLMP48507 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GCLMP48507 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GCLMP48507 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GCLMP48507 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GCLMP48507 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GCLMP48507 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GCLMP48507 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GCLMP48507 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GCLMP48507 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GCLMP48507 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GCLMP48507 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GCLMP48507 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms