Protein–RNA interactions for Protein: P48169

GABRA4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4P48169 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABRA4P48169 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABRA4P48169 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABRA4P48169 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABRA4P48169 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABRA4P48169 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABRA4P48169 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABRA4P48169 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GABRA4P48169 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABRA4P48169 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GABRA4P48169 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABRA4P48169 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABRA4P48169 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GABRA4P48169 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABRA4P48169 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABRA4P48169 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABRA4P48169 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABRA4P48169 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABRA4P48169 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GABRA4P48169 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABRA4P48169 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABRA4P48169 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABRA4P48169 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABRA4P48169 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABRA4P48169 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABRA4P48169 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABRA4P48169 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABRA4P48169 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABRA4P48169 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GABRA4P48169 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABRA4P48169 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABRA4P48169 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABRA4P48169 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABRA4P48169 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABRA4P48169 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABRA4P48169 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABRA4P48169 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABRA4P48169 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABRA4P48169 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABRA4P48169 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABRA4P48169 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABRA4P48169 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABRA4P48169 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABRA4P48169 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABRA4P48169 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABRA4P48169 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABRA4P48169 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GABRA4P48169 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABRA4P48169 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABRA4P48169 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABRA4P48169 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABRA4P48169 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABRA4P48169 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABRA4P48169 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABRA4P48169 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABRA4P48169 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABRA4P48169 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABRA4P48169 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABRA4P48169 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABRA4P48169 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABRA4P48169 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABRA4P48169 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABRA4P48169 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABRA4P48169 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABRA4P48169 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABRA4P48169 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABRA4P48169 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABRA4P48169 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABRA4P48169 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABRA4P48169 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABRA4P48169 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABRA4P48169 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GABRA4P48169 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABRA4P48169 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABRA4P48169 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABRA4P48169 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GABRA4P48169 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABRA4P48169 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABRA4P48169 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GABRA4P48169 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GABRA4P48169 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABRA4P48169 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABRA4P48169 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABRA4P48169 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABRA4P48169 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABRA4P48169 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABRA4P48169 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABRA4P48169 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABRA4P48169 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABRA4P48169 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABRA4P48169 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABRA4P48169 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GABRA4P48169 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABRA4P48169 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABRA4P48169 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABRA4P48169 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABRA4P48169 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRA4P48169 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRA4P48169 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRA4P48169 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms