Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRNA4P43681 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRNA4P43681 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRNA4P43681 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRNA4P43681 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRNA4P43681 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNA4P43681 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNA4P43681 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNA4P43681 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNA4P43681 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNA4P43681 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNA4P43681 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNA4P43681 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNA4P43681 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNA4P43681 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA4P43681 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA4P43681 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA4P43681 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA4P43681 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA4P43681 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA4P43681 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA4P43681 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA4P43681 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA4P43681 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA4P43681 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA4P43681 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA4P43681 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNA4P43681 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNA4P43681 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNA4P43681 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNA4P43681 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNA4P43681 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNA4P43681 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNA4P43681 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNA4P43681 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNA4P43681 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNA4P43681 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNA4P43681 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRNA4P43681 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRNA4P43681 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRNA4P43681 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRNA4P43681 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRNA4P43681 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRNA4P43681 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRNA4P43681 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHRNA4P43681 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNA4P43681 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNA4P43681 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNA4P43681 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNA4P43681 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNA4P43681 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNA4P43681 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNA4P43681 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNA4P43681 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNA4P43681 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNA4P43681 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNA4P43681 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNA4P43681 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNA4P43681 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNA4P43681 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNA4P43681 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNA4P43681 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNA4P43681 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNA4P43681 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNA4P43681 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNA4P43681 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNA4P43681 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNA4P43681 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNA4P43681 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNA4P43681 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNA4P43681 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNA4P43681 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNA4P43681 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNA4P43681 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNA4P43681 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRNA4P43681 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRNA4P43681 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRNA4P43681 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRNA4P43681 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRNA4P43681 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRNA4P43681 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRNA4P43681 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRNA4P43681 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRNA4P43681 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRNA4P43681 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRNA4P43681 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CHRNA4P43681 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHRNA4P43681 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CHRNA4P43681 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CHRNA4P43681 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHRNA4P43681 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CHRNA4P43681 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHRNA4P43681 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHRNA4P43681 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHRNA4P43681 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHRNA4P43681 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHRNA4P43681 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHRNA4P43681 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRNA4P43681 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRNA4P43681 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms