Protein–RNA interactions for Protein: P43378

PTPN9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN9P43378 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPN9P43378 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN9P43378 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN9P43378 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN9P43378 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN9P43378 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN9P43378 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN9P43378 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN9P43378 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPN9P43378 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPN9P43378 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPN9P43378 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPN9P43378 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPN9P43378 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPN9P43378 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPN9P43378 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPN9P43378 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPN9P43378 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPN9P43378 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPN9P43378 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPN9P43378 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPN9P43378 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPN9P43378 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPN9P43378 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPN9P43378 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPN9P43378 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPN9P43378 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPN9P43378 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPN9P43378 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPN9P43378 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPN9P43378 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPN9P43378 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPN9P43378 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPN9P43378 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN9P43378 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN9P43378 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN9P43378 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN9P43378 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN9P43378 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN9P43378 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN9P43378 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN9P43378 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN9P43378 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPN9P43378 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPN9P43378 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPN9P43378 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPN9P43378 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPN9P43378 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPN9P43378 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPN9P43378 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPN9P43378 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPN9P43378 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPN9P43378 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPN9P43378 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPN9P43378 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPN9P43378 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPN9P43378 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPN9P43378 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPN9P43378 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPN9P43378 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPN9P43378 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPN9P43378 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPN9P43378 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPN9P43378 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPN9P43378 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPN9P43378 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPN9P43378 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPN9P43378 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPN9P43378 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PTPN9P43378 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN9P43378 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN9P43378 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN9P43378 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN9P43378 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN9P43378 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN9P43378 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPN9P43378 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPN9P43378 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPN9P43378 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPN9P43378 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPN9P43378 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPN9P43378 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPN9P43378 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPN9P43378 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPN9P43378 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPN9P43378 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPN9P43378 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPN9P43378 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPN9P43378 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPN9P43378 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPN9P43378 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPN9P43378 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPN9P43378 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPN9P43378 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPN9P43378 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPN9P43378 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPN9P43378 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPN9P43378 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPN9P43378 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPN9P43378 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms