Protein–RNA interactions for Protein: P43307

SSR1, Translocon-associated protein subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR1P43307 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSR1P43307 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSR1P43307 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SSR1P43307 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSR1P43307 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSR1P43307 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSR1P43307 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSR1P43307 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SSR1P43307 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SSR1P43307 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SSR1P43307 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SSR1P43307 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SSR1P43307 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SSR1P43307 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SSR1P43307 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SSR1P43307 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SSR1P43307 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SSR1P43307 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SSR1P43307 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SSR1P43307 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SSR1P43307 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SSR1P43307 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SSR1P43307 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SSR1P43307 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SSR1P43307 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SSR1P43307 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SSR1P43307 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SSR1P43307 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SSR1P43307 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SSR1P43307 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SSR1P43307 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SSR1P43307 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SSR1P43307 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SSR1P43307 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSR1P43307 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSR1P43307 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SSR1P43307 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSR1P43307 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSR1P43307 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSR1P43307 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SSR1P43307 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SSR1P43307 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SSR1P43307 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SSR1P43307 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SSR1P43307 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SSR1P43307 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SSR1P43307 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SSR1P43307 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SSR1P43307 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SSR1P43307 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SSR1P43307 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SSR1P43307 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SSR1P43307 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SSR1P43307 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SSR1P43307 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SSR1P43307 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SSR1P43307 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SSR1P43307 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SSR1P43307 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SSR1P43307 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SSR1P43307 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SSR1P43307 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SSR1P43307 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SSR1P43307 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SSR1P43307 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SSR1P43307 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SSR1P43307 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SSR1P43307 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SSR1P43307 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SSR1P43307 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SSR1P43307 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SSR1P43307 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SSR1P43307 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SSR1P43307 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SSR1P43307 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SSR1P43307 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SSR1P43307 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SSR1P43307 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SSR1P43307 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SSR1P43307 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SSR1P43307 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SSR1P43307 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SSR1P43307 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SSR1P43307 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SSR1P43307 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SSR1P43307 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SSR1P43307 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SSR1P43307 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SSR1P43307 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SSR1P43307 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SSR1P43307 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SSR1P43307 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SSR1P43307 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SSR1P43307 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SSR1P43307 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SSR1P43307 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SSR1P43307 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SSR1P43307 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SSR1P43307 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SSR1P43307 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms