Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC1A1P43005 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC1A1P43005 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC1A1P43005 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC1A1P43005 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC1A1P43005 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC1A1P43005 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC1A1P43005 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC1A1P43005 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC1A1P43005 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC1A1P43005 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC1A1P43005 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC1A1P43005 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC1A1P43005 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC1A1P43005 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC1A1P43005 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC1A1P43005 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC1A1P43005 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC1A1P43005 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC1A1P43005 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC1A1P43005 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC1A1P43005 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC1A1P43005 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC1A1P43005 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC1A1P43005 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC1A1P43005 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC1A1P43005 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC1A1P43005 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC1A1P43005 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC1A1P43005 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC1A1P43005 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC1A1P43005 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC1A1P43005 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC1A1P43005 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC1A1P43005 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC1A1P43005 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC1A1P43005 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC1A1P43005 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC1A1P43005 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC1A1P43005 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC1A1P43005 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC1A1P43005 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC1A1P43005 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC1A1P43005 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC1A1P43005 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC1A1P43005 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC1A1P43005 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC1A1P43005 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC1A1P43005 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC1A1P43005 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC1A1P43005 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SLC1A1P43005 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC1A1P43005 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC1A1P43005 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC1A1P43005 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC1A1P43005 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC1A1P43005 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC1A1P43005 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC1A1P43005 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC1A1P43005 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC1A1P43005 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC1A1P43005 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC1A1P43005 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC1A1P43005 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC1A1P43005 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC1A1P43005 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC1A1P43005 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC1A1P43005 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC1A1P43005 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC1A1P43005 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC1A1P43005 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC1A1P43005 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC1A1P43005 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC1A1P43005 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC1A1P43005 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC1A1P43005 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC1A1P43005 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC1A1P43005 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC1A1P43005 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC1A1P43005 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC1A1P43005 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC1A1P43005 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC1A1P43005 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC1A1P43005 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC1A1P43005 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC1A1P43005 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC1A1P43005 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC1A1P43005 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC1A1P43005 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC1A1P43005 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC1A1P43005 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC1A1P43005 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC1A1P43005 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC1A1P43005 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC1A1P43005 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC1A1P43005 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC1A1P43005 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC1A1P43005 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC1A1P43005 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC1A1P43005 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms