Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TMPOP42166 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
TMPOP42166 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
TMPOP42166 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
TMPOP42166 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
TMPOP42166 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
TMPOP42166 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
TMPOP42166 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
TMPOP42166 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
TMPOP42166 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
TMPOP42166 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
TMPOP42166 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
TMPOP42166 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
TMPOP42166 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
TMPOP42166 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
TMPOP42166 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
TMPOP42166 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
TMPOP42166 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
TMPOP42166 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
TMPOP42166 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
TMPOP42166 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
TMPOP42166 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
TMPOP42166 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
TMPOP42166 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
TMPOP42166 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
TMPOP42166 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
TMPOP42166 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
TMPOP42166 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
TMPOP42166 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
TMPOP42166 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
TMPOP42166 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
TMPOP42166 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
TMPOP42166 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
TMPOP42166 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
TMPOP42166 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
TMPOP42166 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
TMPOP42166 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
TMPOP42166 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
TMPOP42166 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
TMPOP42166 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
TMPOP42166 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
TMPOP42166 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
TMPOP42166 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
TMPOP42166 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
TMPOP42166 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
TMPOP42166 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
TMPOP42166 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC31.42■■■□□ 2.62
TMPOP42166 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
TMPOP42166 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
TMPOP42166 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
TMPOP42166 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
TMPOP42166 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
TMPOP42166 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
TMPOP42166 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
TMPOP42166 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
TMPOP42166 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
TMPOP42166 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
TMPOP42166 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
TMPOP42166 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
TMPOP42166 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
TMPOP42166 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
TMPOP42166 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
TMPOP42166 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
TMPOP42166 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
TMPOP42166 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
TMPOP42166 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
TMPOP42166 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
TMPOP42166 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
TMPOP42166 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
TMPOP42166 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
TMPOP42166 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
TMPOP42166 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
TMPOP42166 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC31.37■■■□□ 2.61
TMPOP42166 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC31.37■■■□□ 2.61
TMPOP42166 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
TMPOP42166 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
TMPOP42166 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
TMPOP42166 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
TMPOP42166 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
TMPOP42166 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
TMPOP42166 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
TMPOP42166 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
TMPOP42166 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
TMPOP42166 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
TMPOP42166 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
TMPOP42166 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
TMPOP42166 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
TMPOP42166 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
TMPOP42166 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
TMPOP42166 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
TMPOP42166 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
TMPOP42166 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC31.34■■■□□ 2.61
TMPOP42166 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
TMPOP42166 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
TMPOP42166 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
TMPOP42166 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
TMPOP42166 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
TMPOP42166 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
TMPOP42166 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
TMPOP42166 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms