Protein–RNA interactions for Protein: P41219

PRPH, Peripherin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPHP41219 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRPHP41219 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRPHP41219 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRPHP41219 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRPHP41219 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PRPHP41219 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRPHP41219 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRPHP41219 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRPHP41219 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRPHP41219 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRPHP41219 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PRPHP41219 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PRPHP41219 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRPHP41219 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRPHP41219 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRPHP41219 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRPHP41219 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRPHP41219 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRPHP41219 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRPHP41219 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PRPHP41219 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRPHP41219 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRPHP41219 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRPHP41219 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRPHP41219 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRPHP41219 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRPHP41219 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PRPHP41219 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PRPHP41219 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRPHP41219 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRPHP41219 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRPHP41219 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRPHP41219 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRPHP41219 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRPHP41219 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRPHP41219 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRPHP41219 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRPHP41219 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRPHP41219 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRPHP41219 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRPHP41219 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRPHP41219 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRPHP41219 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRPHP41219 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PRPHP41219 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PRPHP41219 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PRPHP41219 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PRPHP41219 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PRPHP41219 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRPHP41219 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRPHP41219 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRPHP41219 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRPHP41219 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRPHP41219 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRPHP41219 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRPHP41219 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRPHP41219 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRPHP41219 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRPHP41219 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRPHP41219 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRPHP41219 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRPHP41219 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRPHP41219 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRPHP41219 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRPHP41219 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PRPHP41219 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRPHP41219 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRPHP41219 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRPHP41219 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRPHP41219 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRPHP41219 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRPHP41219 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRPHP41219 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRPHP41219 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRPHP41219 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRPHP41219 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRPHP41219 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRPHP41219 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRPHP41219 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRPHP41219 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRPHP41219 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PRPHP41219 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PRPHP41219 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRPHP41219 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRPHP41219 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRPHP41219 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PRPHP41219 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRPHP41219 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PRPHP41219 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRPHP41219 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRPHP41219 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PRPHP41219 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRPHP41219 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRPHP41219 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PRPHP41219 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRPHP41219 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRPHP41219 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRPHP41219 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRPHP41219 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRPHP41219 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms