Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FDFT1P37268 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FDFT1P37268 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FDFT1P37268 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FDFT1P37268 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
FDFT1P37268 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
FDFT1P37268 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FDFT1P37268 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FDFT1P37268 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FDFT1P37268 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FDFT1P37268 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FDFT1P37268 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FDFT1P37268 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FDFT1P37268 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FDFT1P37268 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FDFT1P37268 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FDFT1P37268 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FDFT1P37268 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FDFT1P37268 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FDFT1P37268 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FDFT1P37268 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FDFT1P37268 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FDFT1P37268 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FDFT1P37268 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FDFT1P37268 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
FDFT1P37268 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FDFT1P37268 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FDFT1P37268 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FDFT1P37268 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FDFT1P37268 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FDFT1P37268 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FDFT1P37268 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FDFT1P37268 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FDFT1P37268 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FDFT1P37268 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FDFT1P37268 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FDFT1P37268 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FDFT1P37268 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FDFT1P37268 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FDFT1P37268 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FDFT1P37268 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FDFT1P37268 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
FDFT1P37268 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FDFT1P37268 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FDFT1P37268 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FDFT1P37268 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FDFT1P37268 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FDFT1P37268 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
FDFT1P37268 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FDFT1P37268 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
FDFT1P37268 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FDFT1P37268 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FDFT1P37268 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FDFT1P37268 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FDFT1P37268 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FDFT1P37268 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FDFT1P37268 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FDFT1P37268 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FDFT1P37268 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FDFT1P37268 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FDFT1P37268 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FDFT1P37268 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FDFT1P37268 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FDFT1P37268 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FDFT1P37268 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FDFT1P37268 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FDFT1P37268 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FDFT1P37268 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FDFT1P37268 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FDFT1P37268 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FDFT1P37268 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FDFT1P37268 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FDFT1P37268 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FDFT1P37268 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FDFT1P37268 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FDFT1P37268 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FDFT1P37268 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FDFT1P37268 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FDFT1P37268 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FDFT1P37268 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FDFT1P37268 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FDFT1P37268 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FDFT1P37268 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
FDFT1P37268 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FDFT1P37268 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FDFT1P37268 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FDFT1P37268 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FDFT1P37268 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FDFT1P37268 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FDFT1P37268 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FDFT1P37268 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
FDFT1P37268 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FDFT1P37268 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FDFT1P37268 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FDFT1P37268 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FDFT1P37268 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FDFT1P37268 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FDFT1P37268 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FDFT1P37268 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FDFT1P37268 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms