Protein–RNA interactions for Protein: P35520

CBS, Cystathionine beta-synthase, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBSP35520 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CBSP35520 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CBSP35520 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CBSP35520 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CBSP35520 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CBSP35520 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CBSP35520 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CBSP35520 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CBSP35520 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CBSP35520 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CBSP35520 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CBSP35520 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBSP35520 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBSP35520 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBSP35520 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CBSP35520 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBSP35520 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBSP35520 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBSP35520 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBSP35520 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBSP35520 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBSP35520 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBSP35520 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBSP35520 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBSP35520 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBSP35520 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBSP35520 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBSP35520 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBSP35520 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBSP35520 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CBSP35520 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBSP35520 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBSP35520 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBSP35520 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBSP35520 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBSP35520 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBSP35520 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBSP35520 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBSP35520 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBSP35520 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBSP35520 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBSP35520 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBSP35520 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBSP35520 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBSP35520 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBSP35520 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBSP35520 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBSP35520 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBSP35520 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CBSP35520 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBSP35520 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBSP35520 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CBSP35520 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CBSP35520 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CBSP35520 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CBSP35520 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CBSP35520 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CBSP35520 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CBSP35520 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CBSP35520 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CBSP35520 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CBSP35520 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CBSP35520 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CBSP35520 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CBSP35520 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CBSP35520 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CBSP35520 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CBSP35520 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CBSP35520 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CBSP35520 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CBSP35520 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CBSP35520 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CBSP35520 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CBSP35520 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CBSP35520 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CBSP35520 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CBSP35520 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CBSP35520 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CBSP35520 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CBSP35520 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CBSP35520 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CBSP35520 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CBSP35520 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CBSP35520 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CBSP35520 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CBSP35520 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CBSP35520 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CBSP35520 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CBSP35520 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CBSP35520 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CBSP35520 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CBSP35520 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CBSP35520 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CBSP35520 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CBSP35520 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CBSP35520 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CBSP35520 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CBSP35520 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CBSP35520 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CBSP35520 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms