Protein–RNA interactions for Protein: P31644

GABRA5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA5P31644 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABRA5P31644 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABRA5P31644 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABRA5P31644 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABRA5P31644 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABRA5P31644 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABRA5P31644 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABRA5P31644 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABRA5P31644 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABRA5P31644 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABRA5P31644 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABRA5P31644 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABRA5P31644 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABRA5P31644 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABRA5P31644 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABRA5P31644 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABRA5P31644 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABRA5P31644 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABRA5P31644 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABRA5P31644 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABRA5P31644 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABRA5P31644 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABRA5P31644 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GABRA5P31644 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GABRA5P31644 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GABRA5P31644 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GABRA5P31644 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GABRA5P31644 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GABRA5P31644 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GABRA5P31644 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABRA5P31644 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABRA5P31644 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABRA5P31644 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABRA5P31644 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABRA5P31644 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABRA5P31644 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABRA5P31644 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABRA5P31644 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GABRA5P31644 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABRA5P31644 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABRA5P31644 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABRA5P31644 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABRA5P31644 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABRA5P31644 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABRA5P31644 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABRA5P31644 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABRA5P31644 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABRA5P31644 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABRA5P31644 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABRA5P31644 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABRA5P31644 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABRA5P31644 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABRA5P31644 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABRA5P31644 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABRA5P31644 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABRA5P31644 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABRA5P31644 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABRA5P31644 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABRA5P31644 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABRA5P31644 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABRA5P31644 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABRA5P31644 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABRA5P31644 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABRA5P31644 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABRA5P31644 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABRA5P31644 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABRA5P31644 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABRA5P31644 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GABRA5P31644 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABRA5P31644 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABRA5P31644 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABRA5P31644 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABRA5P31644 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABRA5P31644 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABRA5P31644 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABRA5P31644 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABRA5P31644 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABRA5P31644 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABRA5P31644 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABRA5P31644 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GABRA5P31644 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GABRA5P31644 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GABRA5P31644 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GABRA5P31644 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GABRA5P31644 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GABRA5P31644 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GABRA5P31644 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
GABRA5P31644 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GABRA5P31644 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
GABRA5P31644 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GABRA5P31644 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABRA5P31644 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABRA5P31644 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GABRA5P31644 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABRA5P31644 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABRA5P31644 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABRA5P31644 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABRA5P31644 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABRA5P31644 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABRA5P31644 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms