Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ECHS1P30084 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ECHS1P30084 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ECHS1P30084 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ECHS1P30084 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ECHS1P30084 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ECHS1P30084 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ECHS1P30084 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ECHS1P30084 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ECHS1P30084 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ECHS1P30084 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ECHS1P30084 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ECHS1P30084 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ECHS1P30084 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ECHS1P30084 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ECHS1P30084 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ECHS1P30084 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ECHS1P30084 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ECHS1P30084 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ECHS1P30084 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ECHS1P30084 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ECHS1P30084 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ECHS1P30084 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ECHS1P30084 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ECHS1P30084 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ECHS1P30084 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ECHS1P30084 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ECHS1P30084 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ECHS1P30084 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ECHS1P30084 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ECHS1P30084 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ECHS1P30084 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ECHS1P30084 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ECHS1P30084 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ECHS1P30084 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ECHS1P30084 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ECHS1P30084 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ECHS1P30084 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ECHS1P30084 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ECHS1P30084 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ECHS1P30084 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ECHS1P30084 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ECHS1P30084 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ECHS1P30084 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ECHS1P30084 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ECHS1P30084 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ECHS1P30084 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ECHS1P30084 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ECHS1P30084 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ECHS1P30084 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ECHS1P30084 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ECHS1P30084 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ECHS1P30084 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ECHS1P30084 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ECHS1P30084 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ECHS1P30084 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ECHS1P30084 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ECHS1P30084 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ECHS1P30084 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ECHS1P30084 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ECHS1P30084 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ECHS1P30084 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ECHS1P30084 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ECHS1P30084 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ECHS1P30084 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ECHS1P30084 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ECHS1P30084 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ECHS1P30084 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ECHS1P30084 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ECHS1P30084 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ECHS1P30084 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ECHS1P30084 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ECHS1P30084 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ECHS1P30084 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ECHS1P30084 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ECHS1P30084 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ECHS1P30084 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ECHS1P30084 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ECHS1P30084 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ECHS1P30084 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ECHS1P30084 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ECHS1P30084 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ECHS1P30084 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ECHS1P30084 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ECHS1P30084 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ECHS1P30084 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ECHS1P30084 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ECHS1P30084 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ECHS1P30084 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ECHS1P30084 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ECHS1P30084 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ECHS1P30084 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ECHS1P30084 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ECHS1P30084 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ECHS1P30084 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ECHS1P30084 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ECHS1P30084 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ECHS1P30084 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ECHS1P30084 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ECHS1P30084 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms