Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
KDM5AP29375 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC34.87■■■■□ 3.17
KDM5AP29375 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
KDM5AP29375 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
KDM5AP29375 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
KDM5AP29375 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
KDM5AP29375 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
KDM5AP29375 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
KDM5AP29375 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
KDM5AP29375 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
KDM5AP29375 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
KDM5AP29375 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
KDM5AP29375 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
KDM5AP29375 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
KDM5AP29375 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
KDM5AP29375 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC34.84■■■■□ 3.17
KDM5AP29375 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
KDM5AP29375 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
KDM5AP29375 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
KDM5AP29375 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
KDM5AP29375 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
KDM5AP29375 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.17
KDM5AP29375 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.17
KDM5AP29375 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
KDM5AP29375 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
KDM5AP29375 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
KDM5AP29375 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
KDM5AP29375 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
KDM5AP29375 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
KDM5AP29375 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
KDM5AP29375 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
KDM5AP29375 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC34.81■■■■□ 3.16
KDM5AP29375 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
KDM5AP29375 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
KDM5AP29375 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
KDM5AP29375 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
KDM5AP29375 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
KDM5AP29375 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
KDM5AP29375 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
KDM5AP29375 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
KDM5AP29375 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
KDM5AP29375 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
KDM5AP29375 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
KDM5AP29375 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
KDM5AP29375 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
KDM5AP29375 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC34.78■■■■□ 3.16
KDM5AP29375 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
KDM5AP29375 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
KDM5AP29375 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC34.78■■■■□ 3.16
KDM5AP29375 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC34.78■■■■□ 3.16
KDM5AP29375 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
KDM5AP29375 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
KDM5AP29375 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC34.77■■■■□ 3.16
KDM5AP29375 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC34.77■■■■□ 3.16
KDM5AP29375 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
KDM5AP29375 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
KDM5AP29375 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.16
KDM5AP29375 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
KDM5AP29375 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
KDM5AP29375 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.15
KDM5AP29375 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC34.76■■■■□ 3.15
KDM5AP29375 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
KDM5AP29375 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
KDM5AP29375 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
KDM5AP29375 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
KDM5AP29375 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
KDM5AP29375 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
KDM5AP29375 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
KDM5AP29375 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
KDM5AP29375 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.74■■■■□ 3.15
KDM5AP29375 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC34.74■■■■□ 3.15
KDM5AP29375 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
KDM5AP29375 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
KDM5AP29375 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
KDM5AP29375 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
KDM5AP29375 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
KDM5AP29375 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
KDM5AP29375 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
KDM5AP29375 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
KDM5AP29375 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
KDM5AP29375 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
KDM5AP29375 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
KDM5AP29375 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
KDM5AP29375 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
KDM5AP29375 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
KDM5AP29375 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
KDM5AP29375 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC34.69■■■■□ 3.14
KDM5AP29375 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
KDM5AP29375 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
KDM5AP29375 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
KDM5AP29375 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
KDM5AP29375 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
KDM5AP29375 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
KDM5AP29375 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
KDM5AP29375 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
KDM5AP29375 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
KDM5AP29375 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
KDM5AP29375 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
KDM5AP29375 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
KDM5AP29375 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms