Protein–RNA interactions for Protein: P21941

MATN1, Cartilage matrix protein, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN1P21941 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MATN1P21941 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MATN1P21941 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MATN1P21941 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MATN1P21941 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MATN1P21941 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MATN1P21941 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MATN1P21941 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MATN1P21941 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MATN1P21941 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MATN1P21941 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MATN1P21941 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MATN1P21941 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MATN1P21941 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MATN1P21941 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MATN1P21941 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MATN1P21941 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MATN1P21941 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MATN1P21941 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MATN1P21941 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MATN1P21941 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MATN1P21941 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MATN1P21941 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MATN1P21941 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MATN1P21941 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MATN1P21941 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MATN1P21941 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MATN1P21941 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MATN1P21941 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MATN1P21941 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MATN1P21941 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MATN1P21941 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MATN1P21941 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MATN1P21941 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MATN1P21941 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MATN1P21941 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MATN1P21941 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MATN1P21941 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MATN1P21941 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MATN1P21941 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MATN1P21941 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MATN1P21941 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MATN1P21941 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MATN1P21941 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MATN1P21941 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MATN1P21941 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MATN1P21941 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MATN1P21941 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MATN1P21941 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MATN1P21941 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MATN1P21941 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MATN1P21941 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MATN1P21941 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MATN1P21941 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MATN1P21941 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MATN1P21941 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MATN1P21941 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MATN1P21941 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MATN1P21941 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MATN1P21941 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MATN1P21941 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MATN1P21941 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MATN1P21941 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MATN1P21941 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MATN1P21941 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MATN1P21941 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MATN1P21941 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MATN1P21941 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MATN1P21941 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MATN1P21941 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MATN1P21941 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MATN1P21941 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MATN1P21941 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MATN1P21941 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MATN1P21941 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MATN1P21941 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MATN1P21941 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MATN1P21941 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MATN1P21941 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MATN1P21941 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MATN1P21941 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MATN1P21941 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MATN1P21941 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MATN1P21941 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MATN1P21941 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MATN1P21941 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MATN1P21941 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MATN1P21941 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MATN1P21941 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MATN1P21941 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MATN1P21941 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MATN1P21941 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MATN1P21941 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MATN1P21941 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MATN1P21941 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MATN1P21941 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MATN1P21941 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MATN1P21941 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MATN1P21941 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MATN1P21941 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.2 ms