Protein–RNA interactions for Protein: P21246

PTN, Pleiotrophin, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTNP21246 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PTNP21246 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTNP21246 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTNP21246 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTNP21246 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTNP21246 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTNP21246 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTNP21246 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTNP21246 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTNP21246 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTNP21246 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTNP21246 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTNP21246 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTNP21246 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTNP21246 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTNP21246 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTNP21246 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTNP21246 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTNP21246 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTNP21246 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTNP21246 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTNP21246 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTNP21246 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTNP21246 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTNP21246 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTNP21246 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTNP21246 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTNP21246 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTNP21246 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTNP21246 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTNP21246 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTNP21246 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTNP21246 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTNP21246 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTNP21246 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTNP21246 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTNP21246 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTNP21246 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PTNP21246 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PTNP21246 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PTNP21246 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTNP21246 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTNP21246 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
PTNP21246 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTNP21246 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTNP21246 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTNP21246 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PTNP21246 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTNP21246 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTNP21246 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTNP21246 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTNP21246 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTNP21246 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTNP21246 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTNP21246 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PTNP21246 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTNP21246 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTNP21246 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTNP21246 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTNP21246 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTNP21246 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTNP21246 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTNP21246 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTNP21246 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PTNP21246 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTNP21246 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTNP21246 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTNP21246 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTNP21246 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTNP21246 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTNP21246 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTNP21246 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTNP21246 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTNP21246 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTNP21246 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTNP21246 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTNP21246 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTNP21246 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTNP21246 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTNP21246 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PTNP21246 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTNP21246 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTNP21246 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTNP21246 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTNP21246 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PTNP21246 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTNP21246 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTNP21246 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTNP21246 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTNP21246 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTNP21246 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PTNP21246 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTNP21246 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTNP21246 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTNP21246 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTNP21246 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTNP21246 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTNP21246 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTNP21246 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTNP21246 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms