Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM21P19474 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM21P19474 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM21P19474 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM21P19474 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM21P19474 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM21P19474 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM21P19474 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM21P19474 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM21P19474 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM21P19474 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM21P19474 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM21P19474 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM21P19474 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM21P19474 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM21P19474 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM21P19474 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM21P19474 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM21P19474 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM21P19474 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM21P19474 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM21P19474 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM21P19474 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM21P19474 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM21P19474 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM21P19474 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM21P19474 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM21P19474 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM21P19474 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM21P19474 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM21P19474 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM21P19474 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM21P19474 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM21P19474 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM21P19474 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM21P19474 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM21P19474 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM21P19474 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM21P19474 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM21P19474 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM21P19474 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM21P19474 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM21P19474 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM21P19474 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM21P19474 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM21P19474 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM21P19474 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM21P19474 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM21P19474 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM21P19474 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM21P19474 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM21P19474 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM21P19474 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM21P19474 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM21P19474 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM21P19474 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM21P19474 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM21P19474 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM21P19474 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM21P19474 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM21P19474 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM21P19474 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM21P19474 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM21P19474 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM21P19474 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM21P19474 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM21P19474 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM21P19474 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM21P19474 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM21P19474 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM21P19474 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM21P19474 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM21P19474 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM21P19474 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM21P19474 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM21P19474 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM21P19474 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM21P19474 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM21P19474 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM21P19474 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM21P19474 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM21P19474 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM21P19474 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM21P19474 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM21P19474 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM21P19474 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM21P19474 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM21P19474 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM21P19474 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM21P19474 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM21P19474 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM21P19474 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM21P19474 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM21P19474 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM21P19474 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM21P19474 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM21P19474 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM21P19474 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM21P19474 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM21P19474 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.5 ms