Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
XBP1P17861 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
XBP1P17861 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
XBP1P17861 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
XBP1P17861 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
XBP1P17861 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
XBP1P17861 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
XBP1P17861 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
XBP1P17861 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
XBP1P17861 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
XBP1P17861 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
XBP1P17861 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
XBP1P17861 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
XBP1P17861 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
XBP1P17861 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
XBP1P17861 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.55■■■□□ 2
XBP1P17861 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
XBP1P17861 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
XBP1P17861 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
XBP1P17861 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.55■■■□□ 2
XBP1P17861 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.55■■■□□ 2
XBP1P17861 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
XBP1P17861 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
XBP1P17861 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
XBP1P17861 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
XBP1P17861 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
XBP1P17861 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
XBP1P17861 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
XBP1P17861 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
XBP1P17861 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
XBP1P17861 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.53■■■□□ 2
XBP1P17861 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
XBP1P17861 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
XBP1P17861 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
XBP1P17861 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
XBP1P17861 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
XBP1P17861 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
XBP1P17861 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
XBP1P17861 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
XBP1P17861 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
XBP1P17861 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
XBP1P17861 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
XBP1P17861 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
XBP1P17861 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
XBP1P17861 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
XBP1P17861 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
XBP1P17861 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
XBP1P17861 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
XBP1P17861 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
XBP1P17861 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
XBP1P17861 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
XBP1P17861 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
XBP1P17861 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
XBP1P17861 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
XBP1P17861 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
XBP1P17861 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
XBP1P17861 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
XBP1P17861 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
XBP1P17861 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
XBP1P17861 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
XBP1P17861 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
XBP1P17861 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
XBP1P17861 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
XBP1P17861 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
XBP1P17861 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
XBP1P17861 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
XBP1P17861 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
XBP1P17861 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
XBP1P17861 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
XBP1P17861 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
XBP1P17861 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
XBP1P17861 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
XBP1P17861 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
XBP1P17861 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
XBP1P17861 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
XBP1P17861 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
XBP1P17861 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
XBP1P17861 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
XBP1P17861 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
XBP1P17861 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
XBP1P17861 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
XBP1P17861 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
XBP1P17861 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
XBP1P17861 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
XBP1P17861 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
XBP1P17861 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
XBP1P17861 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
XBP1P17861 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
XBP1P17861 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
XBP1P17861 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
XBP1P17861 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
XBP1P17861 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
XBP1P17861 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
XBP1P17861 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
XBP1P17861 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
XBP1P17861 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
XBP1P17861 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
XBP1P17861 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
XBP1P17861 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
XBP1P17861 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms