Protein–RNA interactions for Protein: P11277

SPTB, Spectrin beta chain, erythrocytic, humanhuman

Predictions only

Length 2,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBP11277 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPTBP11277 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPTBP11277 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPTBP11277 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPTBP11277 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPTBP11277 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPTBP11277 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPTBP11277 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPTBP11277 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPTBP11277 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPTBP11277 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPTBP11277 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPTBP11277 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPTBP11277 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPTBP11277 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPTBP11277 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPTBP11277 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPTBP11277 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPTBP11277 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPTBP11277 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SPTBP11277 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SPTBP11277 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPTBP11277 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPTBP11277 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPTBP11277 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPTBP11277 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SPTBP11277 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPTBP11277 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPTBP11277 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPTBP11277 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPTBP11277 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPTBP11277 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPTBP11277 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPTBP11277 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPTBP11277 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPTBP11277 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SPTBP11277 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPTBP11277 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPTBP11277 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPTBP11277 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPTBP11277 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPTBP11277 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPTBP11277 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPTBP11277 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPTBP11277 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SPTBP11277 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPTBP11277 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPTBP11277 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SPTBP11277 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPTBP11277 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPTBP11277 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPTBP11277 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPTBP11277 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPTBP11277 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPTBP11277 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPTBP11277 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPTBP11277 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPTBP11277 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPTBP11277 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPTBP11277 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPTBP11277 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPTBP11277 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPTBP11277 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPTBP11277 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPTBP11277 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPTBP11277 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPTBP11277 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPTBP11277 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPTBP11277 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPTBP11277 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPTBP11277 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SPTBP11277 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPTBP11277 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPTBP11277 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPTBP11277 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPTBP11277 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPTBP11277 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPTBP11277 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPTBP11277 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPTBP11277 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPTBP11277 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPTBP11277 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPTBP11277 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPTBP11277 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPTBP11277 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SPTBP11277 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SPTBP11277 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPTBP11277 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPTBP11277 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPTBP11277 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPTBP11277 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPTBP11277 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPTBP11277 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPTBP11277 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPTBP11277 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPTBP11277 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPTBP11277 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPTBP11277 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPTBP11277 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPTBP11277 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms