Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NR2F1P10589 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NR2F1P10589 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NR2F1P10589 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NR2F1P10589 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NR2F1P10589 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NR2F1P10589 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NR2F1P10589 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NR2F1P10589 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR2F1P10589 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR2F1P10589 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR2F1P10589 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR2F1P10589 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR2F1P10589 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR2F1P10589 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR2F1P10589 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR2F1P10589 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR2F1P10589 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NR2F1P10589 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR2F1P10589 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR2F1P10589 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR2F1P10589 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR2F1P10589 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NR2F1P10589 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR2F1P10589 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR2F1P10589 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR2F1P10589 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR2F1P10589 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR2F1P10589 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR2F1P10589 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR2F1P10589 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR2F1P10589 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR2F1P10589 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR2F1P10589 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR2F1P10589 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR2F1P10589 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR2F1P10589 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR2F1P10589 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR2F1P10589 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR2F1P10589 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR2F1P10589 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR2F1P10589 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR2F1P10589 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR2F1P10589 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR2F1P10589 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR2F1P10589 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR2F1P10589 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR2F1P10589 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR2F1P10589 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NR2F1P10589 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NR2F1P10589 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NR2F1P10589 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NR2F1P10589 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NR2F1P10589 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NR2F1P10589 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NR2F1P10589 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR2F1P10589 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NR2F1P10589 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR2F1P10589 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR2F1P10589 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR2F1P10589 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR2F1P10589 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR2F1P10589 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR2F1P10589 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR2F1P10589 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR2F1P10589 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR2F1P10589 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR2F1P10589 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR2F1P10589 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NR2F1P10589 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NR2F1P10589 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NR2F1P10589 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NR2F1P10589 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NR2F1P10589 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NR2F1P10589 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NR2F1P10589 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NR2F1P10589 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NR2F1P10589 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NR2F1P10589 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NR2F1P10589 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NR2F1P10589 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NR2F1P10589 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NR2F1P10589 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NR2F1P10589 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NR2F1P10589 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NR2F1P10589 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NR2F1P10589 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NR2F1P10589 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NR2F1P10589 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NR2F1P10589 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NR2F1P10589 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NR2F1P10589 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NR2F1P10589 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NR2F1P10589 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NR2F1P10589 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NR2F1P10589 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NR2F1P10589 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NR2F1P10589 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NR2F1P10589 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NR2F1P10589 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.6 ms