Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
GLI3P10071 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
GLI3P10071 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
GLI3P10071 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
GLI3P10071 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
GLI3P10071 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC32.26■■■□□ 2.75
GLI3P10071 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
GLI3P10071 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
GLI3P10071 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
GLI3P10071 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
GLI3P10071 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
GLI3P10071 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
GLI3P10071 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
GLI3P10071 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
GLI3P10071 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
GLI3P10071 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
GLI3P10071 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
GLI3P10071 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
GLI3P10071 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
GLI3P10071 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
GLI3P10071 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
GLI3P10071 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
GLI3P10071 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
GLI3P10071 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
GLI3P10071 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
GLI3P10071 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
GLI3P10071 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
GLI3P10071 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
GLI3P10071 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
GLI3P10071 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
GLI3P10071 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
GLI3P10071 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
GLI3P10071 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.22■■■□□ 2.75
GLI3P10071 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.22■■■□□ 2.75
GLI3P10071 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
GLI3P10071 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
GLI3P10071 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
GLI3P10071 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
GLI3P10071 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
GLI3P10071 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
GLI3P10071 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
GLI3P10071 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
GLI3P10071 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
GLI3P10071 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
GLI3P10071 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
GLI3P10071 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
GLI3P10071 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
GLI3P10071 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
GLI3P10071 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
GLI3P10071 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
GLI3P10071 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
GLI3P10071 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
GLI3P10071 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
GLI3P10071 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
GLI3P10071 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
GLI3P10071 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
GLI3P10071 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
GLI3P10071 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
GLI3P10071 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
GLI3P10071 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
GLI3P10071 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
GLI3P10071 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
GLI3P10071 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
GLI3P10071 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
GLI3P10071 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
GLI3P10071 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
GLI3P10071 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
GLI3P10071 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
GLI3P10071 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
GLI3P10071 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
GLI3P10071 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
GLI3P10071 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
GLI3P10071 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
GLI3P10071 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
GLI3P10071 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
GLI3P10071 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
GLI3P10071 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
GLI3P10071 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
GLI3P10071 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
GLI3P10071 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
GLI3P10071 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
GLI3P10071 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
GLI3P10071 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
GLI3P10071 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
GLI3P10071 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
GLI3P10071 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
GLI3P10071 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
GLI3P10071 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
GLI3P10071 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
GLI3P10071 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
GLI3P10071 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
GLI3P10071 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
GLI3P10071 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC32.07■■■□□ 2.72
GLI3P10071 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
GLI3P10071 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
GLI3P10071 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
GLI3P10071 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
GLI3P10071 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
GLI3P10071 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
GLI3P10071 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.3 ms