Protein–RNA interactions for Protein: P0CW18

PRSS56, Serine protease 56, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRSS56P0CW18 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRSS56P0CW18 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRSS56P0CW18 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRSS56P0CW18 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PRSS56P0CW18 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRSS56P0CW18 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRSS56P0CW18 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRSS56P0CW18 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRSS56P0CW18 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRSS56P0CW18 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRSS56P0CW18 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRSS56P0CW18 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRSS56P0CW18 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRSS56P0CW18 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRSS56P0CW18 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRSS56P0CW18 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRSS56P0CW18 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRSS56P0CW18 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PRSS56P0CW18 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRSS56P0CW18 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRSS56P0CW18 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRSS56P0CW18 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRSS56P0CW18 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRSS56P0CW18 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRSS56P0CW18 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PRSS56P0CW18 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRSS56P0CW18 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRSS56P0CW18 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRSS56P0CW18 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRSS56P0CW18 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRSS56P0CW18 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRSS56P0CW18 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PRSS56P0CW18 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRSS56P0CW18 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRSS56P0CW18 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRSS56P0CW18 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRSS56P0CW18 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRSS56P0CW18 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRSS56P0CW18 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRSS56P0CW18 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRSS56P0CW18 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRSS56P0CW18 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRSS56P0CW18 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRSS56P0CW18 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRSS56P0CW18 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRSS56P0CW18 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PRSS56P0CW18 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRSS56P0CW18 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRSS56P0CW18 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRSS56P0CW18 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRSS56P0CW18 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRSS56P0CW18 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRSS56P0CW18 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PRSS56P0CW18 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PRSS56P0CW18 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRSS56P0CW18 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRSS56P0CW18 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRSS56P0CW18 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRSS56P0CW18 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRSS56P0CW18 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRSS56P0CW18 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRSS56P0CW18 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRSS56P0CW18 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRSS56P0CW18 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRSS56P0CW18 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRSS56P0CW18 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRSS56P0CW18 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRSS56P0CW18 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRSS56P0CW18 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRSS56P0CW18 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRSS56P0CW18 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRSS56P0CW18 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRSS56P0CW18 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PRSS56P0CW18 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PRSS56P0CW18 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRSS56P0CW18 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRSS56P0CW18 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRSS56P0CW18 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRSS56P0CW18 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRSS56P0CW18 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRSS56P0CW18 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRSS56P0CW18 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRSS56P0CW18 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRSS56P0CW18 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRSS56P0CW18 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRSS56P0CW18 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRSS56P0CW18 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRSS56P0CW18 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRSS56P0CW18 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRSS56P0CW18 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PRSS56P0CW18 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRSS56P0CW18 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRSS56P0CW18 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PRSS56P0CW18 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRSS56P0CW18 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRSS56P0CW18 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRSS56P0CW18 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRSS56P0CW18 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRSS56P0CW18 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRSS56P0CW18 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms