Protein–RNA interactions for Protein: P0CI25

TRIM49, Tripartite motif-containing protein 49, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM49P0CI25 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM49P0CI25 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM49P0CI25 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM49P0CI25 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM49P0CI25 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM49P0CI25 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM49P0CI25 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM49P0CI25 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM49P0CI25 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM49P0CI25 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM49P0CI25 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM49P0CI25 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM49P0CI25 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM49P0CI25 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM49P0CI25 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM49P0CI25 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM49P0CI25 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM49P0CI25 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM49P0CI25 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM49P0CI25 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM49P0CI25 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TRIM49P0CI25 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM49P0CI25 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM49P0CI25 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM49P0CI25 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM49P0CI25 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM49P0CI25 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM49P0CI25 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM49P0CI25 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM49P0CI25 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM49P0CI25 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM49P0CI25 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM49P0CI25 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM49P0CI25 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM49P0CI25 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM49P0CI25 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM49P0CI25 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM49P0CI25 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM49P0CI25 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM49P0CI25 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM49P0CI25 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM49P0CI25 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM49P0CI25 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM49P0CI25 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM49P0CI25 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM49P0CI25 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM49P0CI25 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM49P0CI25 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM49P0CI25 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM49P0CI25 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM49P0CI25 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM49P0CI25 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM49P0CI25 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM49P0CI25 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM49P0CI25 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM49P0CI25 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM49P0CI25 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM49P0CI25 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRIM49P0CI25 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRIM49P0CI25 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM49P0CI25 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM49P0CI25 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM49P0CI25 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM49P0CI25 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM49P0CI25 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM49P0CI25 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM49P0CI25 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM49P0CI25 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM49P0CI25 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM49P0CI25 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM49P0CI25 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM49P0CI25 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM49P0CI25 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM49P0CI25 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM49P0CI25 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM49P0CI25 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM49P0CI25 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM49P0CI25 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM49P0CI25 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM49P0CI25 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM49P0CI25 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM49P0CI25 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM49P0CI25 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM49P0CI25 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM49P0CI25 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM49P0CI25 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM49P0CI25 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM49P0CI25 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM49P0CI25 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM49P0CI25 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM49P0CI25 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM49P0CI25 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM49P0CI25 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM49P0CI25 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TRIM49P0CI25 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
TRIM49P0CI25 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM49P0CI25 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM49P0CI25 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM49P0CI25 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM49P0CI25 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms