Protein–RNA interactions for Protein: P08729

KRT7, Keratin, type II cytoskeletal 7, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT7P08729 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT7P08729 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT7P08729 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT7P08729 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT7P08729 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT7P08729 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT7P08729 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KRT7P08729 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KRT7P08729 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KRT7P08729 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KRT7P08729 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT7P08729 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT7P08729 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT7P08729 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT7P08729 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT7P08729 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT7P08729 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT7P08729 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT7P08729 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT7P08729 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT7P08729 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT7P08729 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT7P08729 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT7P08729 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT7P08729 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT7P08729 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT7P08729 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT7P08729 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT7P08729 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT7P08729 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT7P08729 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT7P08729 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT7P08729 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT7P08729 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT7P08729 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT7P08729 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT7P08729 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT7P08729 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT7P08729 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT7P08729 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT7P08729 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT7P08729 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT7P08729 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
KRT7P08729 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT7P08729 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT7P08729 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT7P08729 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT7P08729 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT7P08729 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT7P08729 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT7P08729 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT7P08729 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT7P08729 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT7P08729 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT7P08729 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT7P08729 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT7P08729 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT7P08729 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT7P08729 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT7P08729 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT7P08729 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT7P08729 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT7P08729 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT7P08729 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT7P08729 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT7P08729 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT7P08729 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT7P08729 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT7P08729 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT7P08729 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT7P08729 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT7P08729 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT7P08729 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT7P08729 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT7P08729 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT7P08729 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT7P08729 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT7P08729 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT7P08729 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT7P08729 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT7P08729 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT7P08729 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT7P08729 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT7P08729 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT7P08729 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT7P08729 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT7P08729 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT7P08729 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT7P08729 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT7P08729 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT7P08729 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT7P08729 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT7P08729 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT7P08729 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT7P08729 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT7P08729 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT7P08729 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT7P08729 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT7P08729 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT7P08729 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms