Protein–RNA interactions for Protein: P07437

TUBB, Tubulin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBBP07437 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBBP07437 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBBP07437 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBBP07437 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBBP07437 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBBP07437 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBBP07437 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBBP07437 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBBP07437 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBBP07437 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBBP07437 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBBP07437 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TUBBP07437 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TUBBP07437 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TUBBP07437 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBBP07437 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBBP07437 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBBP07437 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBBP07437 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBBP07437 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBBP07437 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBBP07437 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBBP07437 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBBP07437 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBBP07437 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBBP07437 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBBP07437 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBBP07437 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBBP07437 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBBP07437 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBBP07437 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBBP07437 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBBP07437 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBBP07437 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBBP07437 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBBP07437 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBBP07437 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBBP07437 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBBP07437 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBBP07437 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBBP07437 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBBP07437 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBBP07437 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBBP07437 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBBP07437 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBBP07437 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBBP07437 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBBP07437 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBBP07437 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBBP07437 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TUBBP07437 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TUBBP07437 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TUBBP07437 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TUBBP07437 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TUBBP07437 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TUBBP07437 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUBBP07437 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUBBP07437 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBBP07437 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBBP07437 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBBP07437 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBBP07437 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBBP07437 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBBP07437 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBBP07437 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBBP07437 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBBP07437 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBBP07437 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBBP07437 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBBP07437 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBBP07437 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBBP07437 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBBP07437 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBBP07437 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBBP07437 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBBP07437 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TUBBP07437 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TUBBP07437 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TUBBP07437 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TUBBP07437 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBBP07437 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBBP07437 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBBP07437 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBBP07437 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBBP07437 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBBP07437 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBBP07437 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBBP07437 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBBP07437 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBBP07437 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBBP07437 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBBP07437 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBBP07437 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBBP07437 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBBP07437 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBBP07437 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBBP07437 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBBP07437 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBBP07437 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBBP07437 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms