Protein–RNA interactions for Protein: O94782

USP1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP1O94782 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP1O94782 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP1O94782 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP1O94782 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP1O94782 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP1O94782 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP1O94782 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP1O94782 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP1O94782 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP1O94782 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP1O94782 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP1O94782 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP1O94782 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP1O94782 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP1O94782 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP1O94782 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP1O94782 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP1O94782 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP1O94782 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
USP1O94782 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP1O94782 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP1O94782 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP1O94782 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP1O94782 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP1O94782 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP1O94782 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP1O94782 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP1O94782 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP1O94782 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP1O94782 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
USP1O94782 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP1O94782 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP1O94782 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP1O94782 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP1O94782 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP1O94782 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP1O94782 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP1O94782 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP1O94782 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP1O94782 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
USP1O94782 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP1O94782 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP1O94782 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP1O94782 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP1O94782 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP1O94782 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP1O94782 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP1O94782 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP1O94782 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP1O94782 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP1O94782 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP1O94782 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP1O94782 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP1O94782 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP1O94782 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP1O94782 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP1O94782 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP1O94782 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP1O94782 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP1O94782 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
USP1O94782 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP1O94782 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP1O94782 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP1O94782 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP1O94782 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP1O94782 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP1O94782 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP1O94782 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP1O94782 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP1O94782 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP1O94782 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP1O94782 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP1O94782 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
USP1O94782 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP1O94782 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP1O94782 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP1O94782 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP1O94782 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
USP1O94782 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP1O94782 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP1O94782 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP1O94782 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP1O94782 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP1O94782 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP1O94782 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP1O94782 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP1O94782 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP1O94782 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP1O94782 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP1O94782 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP1O94782 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP1O94782 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP1O94782 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP1O94782 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP1O94782 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP1O94782 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
USP1O94782 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP1O94782 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP1O94782 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP1O94782 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms