Protein–RNA interactions for Protein: O76011

KRT34, Keratin, type I cuticular Ha4, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT34O76011 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT34O76011 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT34O76011 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT34O76011 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT34O76011 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT34O76011 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT34O76011 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT34O76011 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT34O76011 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT34O76011 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT34O76011 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT34O76011 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT34O76011 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT34O76011 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT34O76011 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT34O76011 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT34O76011 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT34O76011 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT34O76011 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT34O76011 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT34O76011 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT34O76011 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT34O76011 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT34O76011 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT34O76011 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT34O76011 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT34O76011 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT34O76011 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT34O76011 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT34O76011 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT34O76011 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT34O76011 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT34O76011 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT34O76011 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT34O76011 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT34O76011 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT34O76011 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT34O76011 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT34O76011 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT34O76011 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT34O76011 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT34O76011 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT34O76011 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT34O76011 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT34O76011 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT34O76011 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT34O76011 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
KRT34O76011 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KRT34O76011 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT34O76011 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT34O76011 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT34O76011 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT34O76011 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT34O76011 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT34O76011 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT34O76011 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT34O76011 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT34O76011 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT34O76011 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT34O76011 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT34O76011 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT34O76011 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT34O76011 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT34O76011 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT34O76011 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT34O76011 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT34O76011 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT34O76011 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT34O76011 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT34O76011 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT34O76011 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT34O76011 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT34O76011 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT34O76011 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT34O76011 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT34O76011 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT34O76011 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT34O76011 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT34O76011 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT34O76011 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT34O76011 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT34O76011 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT34O76011 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT34O76011 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT34O76011 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT34O76011 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT34O76011 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT34O76011 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT34O76011 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT34O76011 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT34O76011 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT34O76011 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT34O76011 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT34O76011 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT34O76011 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT34O76011 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT34O76011 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT34O76011 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT34O76011 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT34O76011 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms