Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PITX3O75364 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PITX3O75364 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PITX3O75364 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PITX3O75364 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PITX3O75364 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PITX3O75364 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PITX3O75364 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PITX3O75364 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PITX3O75364 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PITX3O75364 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PITX3O75364 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PITX3O75364 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PITX3O75364 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PITX3O75364 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PITX3O75364 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PITX3O75364 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PITX3O75364 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PITX3O75364 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PITX3O75364 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PITX3O75364 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PITX3O75364 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PITX3O75364 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PITX3O75364 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PITX3O75364 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PITX3O75364 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PITX3O75364 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PITX3O75364 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PITX3O75364 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PITX3O75364 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PITX3O75364 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PITX3O75364 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PITX3O75364 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PITX3O75364 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PITX3O75364 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PITX3O75364 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PITX3O75364 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
PITX3O75364 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PITX3O75364 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PITX3O75364 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PITX3O75364 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PITX3O75364 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PITX3O75364 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PITX3O75364 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PITX3O75364 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PITX3O75364 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PITX3O75364 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PITX3O75364 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PITX3O75364 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PITX3O75364 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PITX3O75364 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PITX3O75364 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PITX3O75364 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PITX3O75364 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PITX3O75364 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PITX3O75364 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PITX3O75364 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PITX3O75364 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PITX3O75364 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PITX3O75364 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PITX3O75364 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PITX3O75364 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PITX3O75364 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITX3O75364 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITX3O75364 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITX3O75364 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITX3O75364 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITX3O75364 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITX3O75364 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITX3O75364 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PITX3O75364 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PITX3O75364 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PITX3O75364 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PITX3O75364 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PITX3O75364 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PITX3O75364 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PITX3O75364 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PITX3O75364 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PITX3O75364 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PITX3O75364 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PITX3O75364 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PITX3O75364 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PITX3O75364 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PITX3O75364 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITX3O75364 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITX3O75364 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITX3O75364 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITX3O75364 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITX3O75364 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITX3O75364 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PITX3O75364 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PITX3O75364 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PITX3O75364 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PITX3O75364 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
PITX3O75364 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PITX3O75364 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PITX3O75364 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PITX3O75364 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PITX3O75364 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PITX3O75364 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms