Protein–RNA interactions for Protein: O60938

KERA, Keratocan, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KERAO60938 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KERAO60938 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KERAO60938 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KERAO60938 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KERAO60938 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KERAO60938 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KERAO60938 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KERAO60938 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KERAO60938 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KERAO60938 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KERAO60938 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KERAO60938 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KERAO60938 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KERAO60938 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KERAO60938 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KERAO60938 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KERAO60938 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KERAO60938 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KERAO60938 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KERAO60938 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KERAO60938 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KERAO60938 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KERAO60938 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KERAO60938 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KERAO60938 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KERAO60938 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KERAO60938 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KERAO60938 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KERAO60938 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KERAO60938 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KERAO60938 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KERAO60938 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KERAO60938 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KERAO60938 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KERAO60938 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KERAO60938 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KERAO60938 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KERAO60938 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KERAO60938 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KERAO60938 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KERAO60938 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KERAO60938 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KERAO60938 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
KERAO60938 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KERAO60938 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KERAO60938 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KERAO60938 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KERAO60938 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KERAO60938 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KERAO60938 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KERAO60938 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KERAO60938 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KERAO60938 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KERAO60938 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KERAO60938 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KERAO60938 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KERAO60938 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
KERAO60938 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KERAO60938 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KERAO60938 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KERAO60938 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KERAO60938 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KERAO60938 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KERAO60938 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KERAO60938 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KERAO60938 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KERAO60938 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KERAO60938 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KERAO60938 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KERAO60938 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KERAO60938 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KERAO60938 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KERAO60938 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KERAO60938 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KERAO60938 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KERAO60938 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KERAO60938 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KERAO60938 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KERAO60938 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KERAO60938 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KERAO60938 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KERAO60938 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
KERAO60938 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KERAO60938 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KERAO60938 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KERAO60938 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KERAO60938 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KERAO60938 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KERAO60938 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KERAO60938 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
KERAO60938 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KERAO60938 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KERAO60938 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KERAO60938 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KERAO60938 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KERAO60938 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KERAO60938 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KERAO60938 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KERAO60938 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KERAO60938 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms