Protein–RNA interactions for Protein: O43559

FRS3, Fibroblast growth factor receptor substrate 3, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRS3O43559 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRS3O43559 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRS3O43559 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FRS3O43559 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRS3O43559 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRS3O43559 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FRS3O43559 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRS3O43559 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRS3O43559 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRS3O43559 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FRS3O43559 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
FRS3O43559 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
FRS3O43559 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FRS3O43559 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FRS3O43559 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRS3O43559 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRS3O43559 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRS3O43559 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRS3O43559 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRS3O43559 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FRS3O43559 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FRS3O43559 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FRS3O43559 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FRS3O43559 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FRS3O43559 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FRS3O43559 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FRS3O43559 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FRS3O43559 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FRS3O43559 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FRS3O43559 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FRS3O43559 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FRS3O43559 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FRS3O43559 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FRS3O43559 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FRS3O43559 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FRS3O43559 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FRS3O43559 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FRS3O43559 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FRS3O43559 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FRS3O43559 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FRS3O43559 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FRS3O43559 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FRS3O43559 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FRS3O43559 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FRS3O43559 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FRS3O43559 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FRS3O43559 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FRS3O43559 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FRS3O43559 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FRS3O43559 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FRS3O43559 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FRS3O43559 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FRS3O43559 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FRS3O43559 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FRS3O43559 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FRS3O43559 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FRS3O43559 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FRS3O43559 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FRS3O43559 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FRS3O43559 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FRS3O43559 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
FRS3O43559 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FRS3O43559 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FRS3O43559 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FRS3O43559 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FRS3O43559 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FRS3O43559 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
FRS3O43559 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
FRS3O43559 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FRS3O43559 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
FRS3O43559 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FRS3O43559 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FRS3O43559 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FRS3O43559 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FRS3O43559 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FRS3O43559 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FRS3O43559 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FRS3O43559 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FRS3O43559 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FRS3O43559 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FRS3O43559 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FRS3O43559 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FRS3O43559 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FRS3O43559 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FRS3O43559 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FRS3O43559 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FRS3O43559 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FRS3O43559 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
FRS3O43559 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FRS3O43559 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FRS3O43559 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FRS3O43559 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FRS3O43559 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FRS3O43559 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
FRS3O43559 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FRS3O43559 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRS3O43559 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRS3O43559 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRS3O43559 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRS3O43559 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms