Protein–RNA interactions for Protein: O43292

GPAA1, Glycosylphosphatidylinositol anchor attachment 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAA1O43292 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
GPAA1O43292 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
GPAA1O43292 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
GPAA1O43292 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GPAA1O43292 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
GPAA1O43292 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
GPAA1O43292 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GPAA1O43292 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GPAA1O43292 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GPAA1O43292 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
GPAA1O43292 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GPAA1O43292 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GPAA1O43292 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GPAA1O43292 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GPAA1O43292 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GPAA1O43292 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GPAA1O43292 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GPAA1O43292 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GPAA1O43292 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GPAA1O43292 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GPAA1O43292 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GPAA1O43292 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GPAA1O43292 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
GPAA1O43292 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GPAA1O43292 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GPAA1O43292 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GPAA1O43292 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GPAA1O43292 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GPAA1O43292 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
GPAA1O43292 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GPAA1O43292 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GPAA1O43292 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GPAA1O43292 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GPAA1O43292 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
GPAA1O43292 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
GPAA1O43292 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
GPAA1O43292 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
GPAA1O43292 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GPAA1O43292 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GPAA1O43292 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GPAA1O43292 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GPAA1O43292 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GPAA1O43292 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GPAA1O43292 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GPAA1O43292 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
GPAA1O43292 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GPAA1O43292 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GPAA1O43292 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GPAA1O43292 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GPAA1O43292 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GPAA1O43292 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GPAA1O43292 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GPAA1O43292 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GPAA1O43292 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GPAA1O43292 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
GPAA1O43292 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GPAA1O43292 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GPAA1O43292 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GPAA1O43292 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GPAA1O43292 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GPAA1O43292 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GPAA1O43292 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GPAA1O43292 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GPAA1O43292 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GPAA1O43292 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GPAA1O43292 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GPAA1O43292 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GPAA1O43292 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GPAA1O43292 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GPAA1O43292 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GPAA1O43292 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GPAA1O43292 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GPAA1O43292 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GPAA1O43292 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
GPAA1O43292 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GPAA1O43292 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GPAA1O43292 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GPAA1O43292 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GPAA1O43292 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GPAA1O43292 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GPAA1O43292 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GPAA1O43292 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GPAA1O43292 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GPAA1O43292 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GPAA1O43292 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GPAA1O43292 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GPAA1O43292 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GPAA1O43292 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
GPAA1O43292 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GPAA1O43292 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GPAA1O43292 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GPAA1O43292 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GPAA1O43292 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GPAA1O43292 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GPAA1O43292 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GPAA1O43292 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GPAA1O43292 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GPAA1O43292 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GPAA1O43292 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GPAA1O43292 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms