Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
FANCAO15360 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
FANCAO15360 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
FANCAO15360 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
FANCAO15360 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC36.91■■■■□ 3.5
FANCAO15360 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC36.91■■■■□ 3.5
FANCAO15360 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
FANCAO15360 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
FANCAO15360 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
FANCAO15360 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC36.9■■■■□ 3.5
FANCAO15360 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
FANCAO15360 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
FANCAO15360 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
FANCAO15360 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
FANCAO15360 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC36.89■■■■□ 3.5
FANCAO15360 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
FANCAO15360 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.5
FANCAO15360 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.5
FANCAO15360 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC36.88■■■■□ 3.5
FANCAO15360 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
FANCAO15360 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.49
FANCAO15360 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
FANCAO15360 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
FANCAO15360 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
FANCAO15360 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
FANCAO15360 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
FANCAO15360 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
FANCAO15360 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
FANCAO15360 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
FANCAO15360 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
FANCAO15360 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC36.85■■■■□ 3.49
FANCAO15360 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
FANCAO15360 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
FANCAO15360 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
FANCAO15360 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
FANCAO15360 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
FANCAO15360 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
FANCAO15360 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
FANCAO15360 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC36.82■■■■□ 3.49
FANCAO15360 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
FANCAO15360 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
FANCAO15360 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
FANCAO15360 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
FANCAO15360 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
FANCAO15360 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
FANCAO15360 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
FANCAO15360 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
FANCAO15360 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
FANCAO15360 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC36.81■■■■□ 3.48
FANCAO15360 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
FANCAO15360 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
FANCAO15360 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
FANCAO15360 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
FANCAO15360 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
FANCAO15360 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
FANCAO15360 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
FANCAO15360 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
FANCAO15360 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
FANCAO15360 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.79■■■■□ 3.48
FANCAO15360 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
FANCAO15360 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
FANCAO15360 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
FANCAO15360 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
FANCAO15360 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
FANCAO15360 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
FANCAO15360 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC36.76■■■■□ 3.48
FANCAO15360 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
FANCAO15360 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
FANCAO15360 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
FANCAO15360 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
FANCAO15360 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
FANCAO15360 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
FANCAO15360 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
FANCAO15360 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
FANCAO15360 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
FANCAO15360 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
FANCAO15360 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
FANCAO15360 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
FANCAO15360 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC36.72■■■■□ 3.47
FANCAO15360 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
FANCAO15360 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
FANCAO15360 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
FANCAO15360 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
FANCAO15360 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
FANCAO15360 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
FANCAO15360 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
FANCAO15360 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC36.69■■■■□ 3.46
FANCAO15360 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
FANCAO15360 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
FANCAO15360 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
FANCAO15360 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC36.69■■■■□ 3.46
FANCAO15360 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
FANCAO15360 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
FANCAO15360 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
FANCAO15360 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
FANCAO15360 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
FANCAO15360 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
FANCAO15360 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC36.68■■■■□ 3.46
FANCAO15360 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
FANCAO15360 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms