Protein–RNA interactions for Protein: O15270

SPTLC2, Serine palmitoyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC2O15270 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPTLC2O15270 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPTLC2O15270 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPTLC2O15270 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPTLC2O15270 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SPTLC2O15270 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPTLC2O15270 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPTLC2O15270 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPTLC2O15270 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPTLC2O15270 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPTLC2O15270 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPTLC2O15270 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SPTLC2O15270 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPTLC2O15270 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPTLC2O15270 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPTLC2O15270 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPTLC2O15270 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPTLC2O15270 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPTLC2O15270 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPTLC2O15270 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPTLC2O15270 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SPTLC2O15270 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SPTLC2O15270 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPTLC2O15270 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPTLC2O15270 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPTLC2O15270 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPTLC2O15270 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SPTLC2O15270 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SPTLC2O15270 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SPTLC2O15270 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SPTLC2O15270 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SPTLC2O15270 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SPTLC2O15270 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SPTLC2O15270 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SPTLC2O15270 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SPTLC2O15270 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SPTLC2O15270 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SPTLC2O15270 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SPTLC2O15270 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPTLC2O15270 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPTLC2O15270 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPTLC2O15270 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPTLC2O15270 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPTLC2O15270 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPTLC2O15270 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SPTLC2O15270 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPTLC2O15270 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPTLC2O15270 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPTLC2O15270 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPTLC2O15270 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPTLC2O15270 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPTLC2O15270 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SPTLC2O15270 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SPTLC2O15270 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SPTLC2O15270 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SPTLC2O15270 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SPTLC2O15270 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SPTLC2O15270 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SPTLC2O15270 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SPTLC2O15270 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SPTLC2O15270 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPTLC2O15270 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPTLC2O15270 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPTLC2O15270 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPTLC2O15270 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPTLC2O15270 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPTLC2O15270 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPTLC2O15270 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPTLC2O15270 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPTLC2O15270 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPTLC2O15270 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPTLC2O15270 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPTLC2O15270 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPTLC2O15270 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPTLC2O15270 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SPTLC2O15270 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPTLC2O15270 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPTLC2O15270 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SPTLC2O15270 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SPTLC2O15270 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SPTLC2O15270 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SPTLC2O15270 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SPTLC2O15270 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SPTLC2O15270 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPTLC2O15270 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPTLC2O15270 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPTLC2O15270 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPTLC2O15270 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPTLC2O15270 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPTLC2O15270 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPTLC2O15270 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SPTLC2O15270 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SPTLC2O15270 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SPTLC2O15270 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SPTLC2O15270 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SPTLC2O15270 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
SPTLC2O15270 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SPTLC2O15270 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SPTLC2O15270 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SPTLC2O15270 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms