Protein–RNA interactions for Protein: O14558

HSPB6, Heat shock protein beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB6O14558 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HSPB6O14558 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HSPB6O14558 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HSPB6O14558 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HSPB6O14558 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HSPB6O14558 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HSPB6O14558 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HSPB6O14558 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HSPB6O14558 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HSPB6O14558 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HSPB6O14558 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HSPB6O14558 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HSPB6O14558 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HSPB6O14558 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HSPB6O14558 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HSPB6O14558 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HSPB6O14558 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HSPB6O14558 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HSPB6O14558 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HSPB6O14558 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HSPB6O14558 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HSPB6O14558 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HSPB6O14558 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HSPB6O14558 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HSPB6O14558 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HSPB6O14558 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HSPB6O14558 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HSPB6O14558 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HSPB6O14558 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HSPB6O14558 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HSPB6O14558 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HSPB6O14558 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HSPB6O14558 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HSPB6O14558 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HSPB6O14558 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HSPB6O14558 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HSPB6O14558 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HSPB6O14558 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HSPB6O14558 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HSPB6O14558 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HSPB6O14558 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HSPB6O14558 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HSPB6O14558 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HSPB6O14558 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HSPB6O14558 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HSPB6O14558 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HSPB6O14558 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HSPB6O14558 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HSPB6O14558 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HSPB6O14558 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HSPB6O14558 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HSPB6O14558 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HSPB6O14558 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HSPB6O14558 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HSPB6O14558 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HSPB6O14558 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HSPB6O14558 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HSPB6O14558 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HSPB6O14558 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HSPB6O14558 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HSPB6O14558 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HSPB6O14558 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HSPB6O14558 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HSPB6O14558 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HSPB6O14558 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HSPB6O14558 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HSPB6O14558 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HSPB6O14558 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HSPB6O14558 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HSPB6O14558 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HSPB6O14558 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HSPB6O14558 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HSPB6O14558 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HSPB6O14558 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HSPB6O14558 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HSPB6O14558 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HSPB6O14558 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HSPB6O14558 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HSPB6O14558 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HSPB6O14558 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HSPB6O14558 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HSPB6O14558 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HSPB6O14558 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HSPB6O14558 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HSPB6O14558 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HSPB6O14558 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HSPB6O14558 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HSPB6O14558 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HSPB6O14558 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HSPB6O14558 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HSPB6O14558 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HSPB6O14558 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HSPB6O14558 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HSPB6O14558 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HSPB6O14558 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HSPB6O14558 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HSPB6O14558 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HSPB6O14558 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HSPB6O14558 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HSPB6O14558 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms