Protein–RNA interactions for Protein: O00451

GFRA2, GDNF family receptor alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA2O00451 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GFRA2O00451 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GFRA2O00451 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GFRA2O00451 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GFRA2O00451 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GFRA2O00451 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GFRA2O00451 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GFRA2O00451 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GFRA2O00451 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GFRA2O00451 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GFRA2O00451 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GFRA2O00451 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GFRA2O00451 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GFRA2O00451 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GFRA2O00451 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GFRA2O00451 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GFRA2O00451 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GFRA2O00451 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GFRA2O00451 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GFRA2O00451 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GFRA2O00451 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GFRA2O00451 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GFRA2O00451 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GFRA2O00451 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GFRA2O00451 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GFRA2O00451 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GFRA2O00451 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GFRA2O00451 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GFRA2O00451 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GFRA2O00451 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GFRA2O00451 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GFRA2O00451 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GFRA2O00451 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GFRA2O00451 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GFRA2O00451 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GFRA2O00451 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GFRA2O00451 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GFRA2O00451 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GFRA2O00451 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GFRA2O00451 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GFRA2O00451 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GFRA2O00451 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GFRA2O00451 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GFRA2O00451 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GFRA2O00451 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GFRA2O00451 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GFRA2O00451 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GFRA2O00451 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GFRA2O00451 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GFRA2O00451 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GFRA2O00451 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GFRA2O00451 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GFRA2O00451 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GFRA2O00451 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GFRA2O00451 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GFRA2O00451 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GFRA2O00451 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GFRA2O00451 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GFRA2O00451 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GFRA2O00451 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GFRA2O00451 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GFRA2O00451 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GFRA2O00451 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GFRA2O00451 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GFRA2O00451 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GFRA2O00451 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GFRA2O00451 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GFRA2O00451 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GFRA2O00451 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GFRA2O00451 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GFRA2O00451 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GFRA2O00451 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GFRA2O00451 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GFRA2O00451 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GFRA2O00451 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GFRA2O00451 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GFRA2O00451 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GFRA2O00451 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GFRA2O00451 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GFRA2O00451 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GFRA2O00451 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GFRA2O00451 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GFRA2O00451 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GFRA2O00451 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GFRA2O00451 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GFRA2O00451 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GFRA2O00451 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GFRA2O00451 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GFRA2O00451 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GFRA2O00451 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GFRA2O00451 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GFRA2O00451 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GFRA2O00451 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GFRA2O00451 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GFRA2O00451 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GFRA2O00451 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GFRA2O00451 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GFRA2O00451 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GFRA2O00451 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GFRA2O00451 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms