Protein–RNA interactions for Protein: F8VWA3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8VWA3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
F8VWA3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
F8VWA3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
F8VWA3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
F8VWA3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
F8VWA3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
F8VWA3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
F8VWA3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
F8VWA3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
F8VWA3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
F8VWA3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
F8VWA3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
F8VWA3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
F8VWA3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
F8VWA3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
F8VWA3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
F8VWA3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
F8VWA3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
F8VWA3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
F8VWA3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
F8VWA3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
F8VWA3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
F8VWA3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
F8VWA3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
F8VWA3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
F8VWA3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
F8VWA3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
F8VWA3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
F8VWA3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
F8VWA3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
F8VWA3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
F8VWA3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
F8VWA3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
F8VWA3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
F8VWA3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
F8VWA3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
F8VWA3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
F8VWA3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
F8VWA3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
F8VWA3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
F8VWA3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
F8VWA3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
F8VWA3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
F8VWA3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
F8VWA3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
F8VWA3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
F8VWA3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
F8VWA3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
F8VWA3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
F8VWA3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
F8VWA3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
F8VWA3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
F8VWA3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
F8VWA3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
F8VWA3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
F8VWA3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
F8VWA3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
F8VWA3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
F8VWA3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
F8VWA3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
F8VWA3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
F8VWA3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
F8VWA3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
F8VWA3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
F8VWA3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
F8VWA3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
F8VWA3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
F8VWA3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
F8VWA3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
F8VWA3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
F8VWA3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
F8VWA3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
F8VWA3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
F8VWA3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
F8VWA3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
F8VWA3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
F8VWA3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
F8VWA3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
F8VWA3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
F8VWA3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
F8VWA3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
F8VWA3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
F8VWA3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
F8VWA3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
F8VWA3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
F8VWA3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
F8VWA3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
F8VWA3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
F8VWA3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
F8VWA3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
F8VWA3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
F8VWA3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
F8VWA3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
F8VWA3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
F8VWA3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
F8VWA3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
F8VWA3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
F8VWA3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
F8VWA3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
F8VWA3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms