Protein–RNA interactions for Protein: E9PJ23

NPIPB6, Nuclear pore complex-interacting protein family member B6, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB6E9PJ23 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NPIPB6E9PJ23 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NPIPB6E9PJ23 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NPIPB6E9PJ23 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NPIPB6E9PJ23 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPIPB6E9PJ23 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NPIPB6E9PJ23 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NPIPB6E9PJ23 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPIPB6E9PJ23 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPIPB6E9PJ23 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPIPB6E9PJ23 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPIPB6E9PJ23 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPIPB6E9PJ23 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPIPB6E9PJ23 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NPIPB6E9PJ23 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPIPB6E9PJ23 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPIPB6E9PJ23 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPIPB6E9PJ23 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPIPB6E9PJ23 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPIPB6E9PJ23 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPIPB6E9PJ23 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPIPB6E9PJ23 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPIPB6E9PJ23 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPIPB6E9PJ23 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NPIPB6E9PJ23 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPIPB6E9PJ23 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPIPB6E9PJ23 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPIPB6E9PJ23 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPIPB6E9PJ23 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPIPB6E9PJ23 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPIPB6E9PJ23 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPIPB6E9PJ23 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPIPB6E9PJ23 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPIPB6E9PJ23 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPIPB6E9PJ23 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPIPB6E9PJ23 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPIPB6E9PJ23 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPIPB6E9PJ23 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPIPB6E9PJ23 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPIPB6E9PJ23 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NPIPB6E9PJ23 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NPIPB6E9PJ23 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NPIPB6E9PJ23 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NPIPB6E9PJ23 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NPIPB6E9PJ23 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NPIPB6E9PJ23 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NPIPB6E9PJ23 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NPIPB6E9PJ23 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NPIPB6E9PJ23 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPIPB6E9PJ23 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPIPB6E9PJ23 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPIPB6E9PJ23 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPIPB6E9PJ23 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPIPB6E9PJ23 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NPIPB6E9PJ23 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NPIPB6E9PJ23 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NPIPB6E9PJ23 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NPIPB6E9PJ23 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPIPB6E9PJ23 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPIPB6E9PJ23 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPIPB6E9PJ23 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPIPB6E9PJ23 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPIPB6E9PJ23 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPIPB6E9PJ23 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPIPB6E9PJ23 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPIPB6E9PJ23 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPIPB6E9PJ23 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NPIPB6E9PJ23 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPIPB6E9PJ23 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPIPB6E9PJ23 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPIPB6E9PJ23 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPIPB6E9PJ23 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPIPB6E9PJ23 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPIPB6E9PJ23 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NPIPB6E9PJ23 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPIPB6E9PJ23 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPIPB6E9PJ23 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPIPB6E9PJ23 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPIPB6E9PJ23 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NPIPB6E9PJ23 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPIPB6E9PJ23 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPIPB6E9PJ23 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPIPB6E9PJ23 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPIPB6E9PJ23 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPIPB6E9PJ23 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPIPB6E9PJ23 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPIPB6E9PJ23 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPIPB6E9PJ23 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPIPB6E9PJ23 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NPIPB6E9PJ23 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPIPB6E9PJ23 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPIPB6E9PJ23 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPIPB6E9PJ23 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPIPB6E9PJ23 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPIPB6E9PJ23 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPIPB6E9PJ23 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NPIPB6E9PJ23 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPIPB6E9PJ23 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPIPB6E9PJ23 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPIPB6E9PJ23 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms