Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF879B4DU55 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF879B4DU55 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF879B4DU55 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF879B4DU55 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF879B4DU55 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF879B4DU55 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF879B4DU55 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF879B4DU55 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF879B4DU55 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF879B4DU55 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF879B4DU55 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF879B4DU55 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF879B4DU55 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF879B4DU55 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF879B4DU55 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF879B4DU55 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF879B4DU55 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF879B4DU55 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF879B4DU55 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF879B4DU55 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF879B4DU55 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF879B4DU55 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF879B4DU55 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF879B4DU55 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF879B4DU55 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF879B4DU55 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF879B4DU55 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF879B4DU55 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF879B4DU55 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF879B4DU55 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF879B4DU55 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF879B4DU55 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF879B4DU55 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF879B4DU55 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF879B4DU55 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF879B4DU55 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF879B4DU55 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF879B4DU55 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF879B4DU55 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF879B4DU55 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF879B4DU55 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ZNF879B4DU55 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ZNF879B4DU55 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ZNF879B4DU55 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF879B4DU55 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF879B4DU55 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF879B4DU55 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF879B4DU55 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF879B4DU55 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF879B4DU55 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF879B4DU55 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF879B4DU55 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ZNF879B4DU55 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF879B4DU55 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF879B4DU55 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF879B4DU55 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF879B4DU55 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF879B4DU55 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF879B4DU55 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF879B4DU55 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF879B4DU55 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF879B4DU55 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF879B4DU55 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF879B4DU55 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF879B4DU55 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF879B4DU55 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZNF879B4DU55 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF879B4DU55 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF879B4DU55 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF879B4DU55 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF879B4DU55 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF879B4DU55 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ZNF879B4DU55 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF879B4DU55 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF879B4DU55 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF879B4DU55 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF879B4DU55 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF879B4DU55 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF879B4DU55 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF879B4DU55 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF879B4DU55 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF879B4DU55 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF879B4DU55 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF879B4DU55 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF879B4DU55 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF879B4DU55 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF879B4DU55 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF879B4DU55 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF879B4DU55 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF879B4DU55 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF879B4DU55 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ZNF879B4DU55 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF879B4DU55 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF879B4DU55 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF879B4DU55 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF879B4DU55 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF879B4DU55 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF879B4DU55 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF879B4DU55 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms