Protein–RNA interactions for Protein: A6XGL0

YJEFN3, YjeF N-terminal domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YJEFN3A6XGL0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
YJEFN3A6XGL0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
YJEFN3A6XGL0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
YJEFN3A6XGL0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
YJEFN3A6XGL0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
YJEFN3A6XGL0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
YJEFN3A6XGL0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
YJEFN3A6XGL0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
YJEFN3A6XGL0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
YJEFN3A6XGL0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
YJEFN3A6XGL0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
YJEFN3A6XGL0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
YJEFN3A6XGL0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
YJEFN3A6XGL0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
YJEFN3A6XGL0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
YJEFN3A6XGL0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
YJEFN3A6XGL0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
YJEFN3A6XGL0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
YJEFN3A6XGL0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
YJEFN3A6XGL0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
YJEFN3A6XGL0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
YJEFN3A6XGL0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
YJEFN3A6XGL0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
YJEFN3A6XGL0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
YJEFN3A6XGL0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
YJEFN3A6XGL0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
YJEFN3A6XGL0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
YJEFN3A6XGL0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
YJEFN3A6XGL0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
YJEFN3A6XGL0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
YJEFN3A6XGL0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
YJEFN3A6XGL0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
YJEFN3A6XGL0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
YJEFN3A6XGL0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
YJEFN3A6XGL0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
YJEFN3A6XGL0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
YJEFN3A6XGL0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
YJEFN3A6XGL0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
YJEFN3A6XGL0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
YJEFN3A6XGL0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
YJEFN3A6XGL0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
YJEFN3A6XGL0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
YJEFN3A6XGL0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
YJEFN3A6XGL0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
YJEFN3A6XGL0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
YJEFN3A6XGL0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
YJEFN3A6XGL0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
YJEFN3A6XGL0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
YJEFN3A6XGL0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
YJEFN3A6XGL0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
YJEFN3A6XGL0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
YJEFN3A6XGL0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
YJEFN3A6XGL0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
YJEFN3A6XGL0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
YJEFN3A6XGL0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
YJEFN3A6XGL0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
YJEFN3A6XGL0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
YJEFN3A6XGL0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
YJEFN3A6XGL0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
YJEFN3A6XGL0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
YJEFN3A6XGL0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
YJEFN3A6XGL0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
YJEFN3A6XGL0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
YJEFN3A6XGL0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
YJEFN3A6XGL0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
YJEFN3A6XGL0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
YJEFN3A6XGL0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
YJEFN3A6XGL0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
YJEFN3A6XGL0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
YJEFN3A6XGL0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
YJEFN3A6XGL0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
YJEFN3A6XGL0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
YJEFN3A6XGL0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
YJEFN3A6XGL0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
YJEFN3A6XGL0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
YJEFN3A6XGL0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
YJEFN3A6XGL0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
YJEFN3A6XGL0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
YJEFN3A6XGL0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
YJEFN3A6XGL0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
YJEFN3A6XGL0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
YJEFN3A6XGL0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
YJEFN3A6XGL0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
YJEFN3A6XGL0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
YJEFN3A6XGL0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
YJEFN3A6XGL0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
YJEFN3A6XGL0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
YJEFN3A6XGL0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
YJEFN3A6XGL0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
YJEFN3A6XGL0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
YJEFN3A6XGL0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
YJEFN3A6XGL0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
YJEFN3A6XGL0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
YJEFN3A6XGL0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
YJEFN3A6XGL0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
YJEFN3A6XGL0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
YJEFN3A6XGL0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
YJEFN3A6XGL0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
YJEFN3A6XGL0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
YJEFN3A6XGL0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms