Protein–RNA interactions for Protein: A6NJW4

LRRC3C, Leucine-rich repeat-containing protein 3C, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3CA6NJW4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC3CA6NJW4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC3CA6NJW4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC3CA6NJW4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC3CA6NJW4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC3CA6NJW4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC3CA6NJW4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC3CA6NJW4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC3CA6NJW4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC3CA6NJW4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC3CA6NJW4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC3CA6NJW4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC3CA6NJW4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC3CA6NJW4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC3CA6NJW4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC3CA6NJW4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC3CA6NJW4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC3CA6NJW4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC3CA6NJW4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC3CA6NJW4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC3CA6NJW4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC3CA6NJW4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC3CA6NJW4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC3CA6NJW4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC3CA6NJW4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC3CA6NJW4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC3CA6NJW4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC3CA6NJW4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC3CA6NJW4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC3CA6NJW4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC3CA6NJW4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC3CA6NJW4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC3CA6NJW4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC3CA6NJW4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC3CA6NJW4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC3CA6NJW4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC3CA6NJW4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC3CA6NJW4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC3CA6NJW4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC3CA6NJW4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC3CA6NJW4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC3CA6NJW4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC3CA6NJW4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC3CA6NJW4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC3CA6NJW4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC3CA6NJW4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC3CA6NJW4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC3CA6NJW4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC3CA6NJW4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC3CA6NJW4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC3CA6NJW4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC3CA6NJW4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC3CA6NJW4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC3CA6NJW4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC3CA6NJW4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC3CA6NJW4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC3CA6NJW4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC3CA6NJW4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC3CA6NJW4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC3CA6NJW4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC3CA6NJW4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC3CA6NJW4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC3CA6NJW4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC3CA6NJW4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC3CA6NJW4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC3CA6NJW4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC3CA6NJW4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC3CA6NJW4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC3CA6NJW4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC3CA6NJW4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC3CA6NJW4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC3CA6NJW4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC3CA6NJW4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC3CA6NJW4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC3CA6NJW4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC3CA6NJW4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC3CA6NJW4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC3CA6NJW4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC3CA6NJW4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC3CA6NJW4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC3CA6NJW4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC3CA6NJW4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC3CA6NJW4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC3CA6NJW4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC3CA6NJW4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC3CA6NJW4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LRRC3CA6NJW4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LRRC3CA6NJW4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LRRC3CA6NJW4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LRRC3CA6NJW4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRC3CA6NJW4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRC3CA6NJW4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRC3CA6NJW4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRC3CA6NJW4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRC3CA6NJW4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRC3CA6NJW4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC3CA6NJW4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC3CA6NJW4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC3CA6NJW4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC3CA6NJW4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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