Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC69A6NI79 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
CCDC69A6NI79 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.08■■■□□ 2.08
CCDC69A6NI79 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC69A6NI79 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC69A6NI79 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC69A6NI79 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC69A6NI79 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC69A6NI79 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC69A6NI79 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC69A6NI79 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC69A6NI79 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC69A6NI79 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC69A6NI79 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC69A6NI79 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC69A6NI79 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC69A6NI79 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC69A6NI79 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC69A6NI79 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC69A6NI79 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC69A6NI79 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC69A6NI79 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC69A6NI79 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC69A6NI79 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC69A6NI79 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC69A6NI79 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC69A6NI79 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC69A6NI79 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC69A6NI79 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC69A6NI79 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC69A6NI79 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC69A6NI79 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC69A6NI79 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC69A6NI79 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC69A6NI79 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC69A6NI79 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC69A6NI79 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC69A6NI79 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC69A6NI79 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC69A6NI79 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC69A6NI79 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CCDC69A6NI79 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CCDC69A6NI79 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC69A6NI79 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC69A6NI79 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC69A6NI79 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC69A6NI79 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC69A6NI79 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC69A6NI79 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CCDC69A6NI79 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC69A6NI79 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC69A6NI79 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC69A6NI79 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC69A6NI79 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC69A6NI79 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC69A6NI79 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC69A6NI79 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC69A6NI79 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC69A6NI79 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC69A6NI79 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC69A6NI79 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC69A6NI79 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC69A6NI79 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC69A6NI79 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC69A6NI79 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC69A6NI79 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC69A6NI79 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC69A6NI79 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC69A6NI79 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC69A6NI79 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC69A6NI79 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC69A6NI79 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC69A6NI79 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC69A6NI79 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC69A6NI79 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC69A6NI79 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC69A6NI79 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC69A6NI79 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC69A6NI79 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC69A6NI79 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC69A6NI79 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC69A6NI79 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC69A6NI79 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC69A6NI79 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC69A6NI79 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC69A6NI79 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC69A6NI79 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC69A6NI79 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC69A6NI79 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC69A6NI79 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC69A6NI79 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC69A6NI79 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC69A6NI79 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC69A6NI79 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC69A6NI79 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC69A6NI79 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC69A6NI79 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC69A6NI79 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC69A6NI79 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC69A6NI79 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms