Protein–RNA interactions for Protein: A6NHN6

NPIPB15, Nuclear pore complex-interacting protein family member B15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB15A6NHN6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NPIPB15A6NHN6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NPIPB15A6NHN6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NPIPB15A6NHN6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NPIPB15A6NHN6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NPIPB15A6NHN6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NPIPB15A6NHN6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NPIPB15A6NHN6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NPIPB15A6NHN6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NPIPB15A6NHN6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NPIPB15A6NHN6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NPIPB15A6NHN6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NPIPB15A6NHN6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NPIPB15A6NHN6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NPIPB15A6NHN6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NPIPB15A6NHN6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NPIPB15A6NHN6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NPIPB15A6NHN6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NPIPB15A6NHN6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NPIPB15A6NHN6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NPIPB15A6NHN6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NPIPB15A6NHN6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NPIPB15A6NHN6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NPIPB15A6NHN6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NPIPB15A6NHN6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NPIPB15A6NHN6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NPIPB15A6NHN6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NPIPB15A6NHN6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NPIPB15A6NHN6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NPIPB15A6NHN6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NPIPB15A6NHN6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NPIPB15A6NHN6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NPIPB15A6NHN6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NPIPB15A6NHN6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NPIPB15A6NHN6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NPIPB15A6NHN6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPIPB15A6NHN6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPIPB15A6NHN6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPIPB15A6NHN6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPIPB15A6NHN6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPIPB15A6NHN6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPIPB15A6NHN6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPIPB15A6NHN6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPIPB15A6NHN6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPIPB15A6NHN6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NPIPB15A6NHN6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NPIPB15A6NHN6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NPIPB15A6NHN6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NPIPB15A6NHN6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NPIPB15A6NHN6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NPIPB15A6NHN6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NPIPB15A6NHN6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NPIPB15A6NHN6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NPIPB15A6NHN6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NPIPB15A6NHN6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NPIPB15A6NHN6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NPIPB15A6NHN6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NPIPB15A6NHN6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NPIPB15A6NHN6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NPIPB15A6NHN6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NPIPB15A6NHN6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NPIPB15A6NHN6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NPIPB15A6NHN6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NPIPB15A6NHN6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NPIPB15A6NHN6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NPIPB15A6NHN6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NPIPB15A6NHN6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NPIPB15A6NHN6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NPIPB15A6NHN6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NPIPB15A6NHN6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NPIPB15A6NHN6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NPIPB15A6NHN6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NPIPB15A6NHN6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NPIPB15A6NHN6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NPIPB15A6NHN6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NPIPB15A6NHN6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NPIPB15A6NHN6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NPIPB15A6NHN6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NPIPB15A6NHN6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NPIPB15A6NHN6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NPIPB15A6NHN6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NPIPB15A6NHN6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NPIPB15A6NHN6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NPIPB15A6NHN6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NPIPB15A6NHN6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NPIPB15A6NHN6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NPIPB15A6NHN6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NPIPB15A6NHN6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NPIPB15A6NHN6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NPIPB15A6NHN6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NPIPB15A6NHN6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NPIPB15A6NHN6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NPIPB15A6NHN6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NPIPB15A6NHN6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NPIPB15A6NHN6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NPIPB15A6NHN6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NPIPB15A6NHN6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NPIPB15A6NHN6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NPIPB15A6NHN6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NPIPB15A6NHN6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms