Protein–RNA interactions for Protein: A1X283

SH3PXD2B, SH3 and PX domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3PXD2BA1X283 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3PXD2BA1X283 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3PXD2BA1X283 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3PXD2BA1X283 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3PXD2BA1X283 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SH3PXD2BA1X283 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3PXD2BA1X283 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3PXD2BA1X283 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3PXD2BA1X283 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3PXD2BA1X283 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3PXD2BA1X283 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3PXD2BA1X283 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3PXD2BA1X283 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3PXD2BA1X283 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3PXD2BA1X283 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3PXD2BA1X283 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3PXD2BA1X283 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3PXD2BA1X283 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3PXD2BA1X283 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3PXD2BA1X283 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3PXD2BA1X283 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3PXD2BA1X283 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3PXD2BA1X283 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3PXD2BA1X283 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3PXD2BA1X283 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3PXD2BA1X283 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3PXD2BA1X283 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3PXD2BA1X283 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3PXD2BA1X283 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3PXD2BA1X283 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3PXD2BA1X283 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3PXD2BA1X283 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3PXD2BA1X283 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3PXD2BA1X283 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3PXD2BA1X283 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3PXD2BA1X283 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3PXD2BA1X283 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3PXD2BA1X283 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3PXD2BA1X283 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3PXD2BA1X283 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3PXD2BA1X283 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3PXD2BA1X283 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3PXD2BA1X283 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3PXD2BA1X283 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SH3PXD2BA1X283 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SH3PXD2BA1X283 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SH3PXD2BA1X283 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH3PXD2BA1X283 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH3PXD2BA1X283 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH3PXD2BA1X283 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH3PXD2BA1X283 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH3PXD2BA1X283 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH3PXD2BA1X283 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH3PXD2BA1X283 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3PXD2BA1X283 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3PXD2BA1X283 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3PXD2BA1X283 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3PXD2BA1X283 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3PXD2BA1X283 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3PXD2BA1X283 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3PXD2BA1X283 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3PXD2BA1X283 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3PXD2BA1X283 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3PXD2BA1X283 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3PXD2BA1X283 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3PXD2BA1X283 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3PXD2BA1X283 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3PXD2BA1X283 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3PXD2BA1X283 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3PXD2BA1X283 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3PXD2BA1X283 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3PXD2BA1X283 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3PXD2BA1X283 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3PXD2BA1X283 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3PXD2BA1X283 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3PXD2BA1X283 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3PXD2BA1X283 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3PXD2BA1X283 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3PXD2BA1X283 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3PXD2BA1X283 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3PXD2BA1X283 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3PXD2BA1X283 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3PXD2BA1X283 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3PXD2BA1X283 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3PXD2BA1X283 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3PXD2BA1X283 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3PXD2BA1X283 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3PXD2BA1X283 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3PXD2BA1X283 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3PXD2BA1X283 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3PXD2BA1X283 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3PXD2BA1X283 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3PXD2BA1X283 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3PXD2BA1X283 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3PXD2BA1X283 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3PXD2BA1X283 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3PXD2BA1X283 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3PXD2BA1X283 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3PXD2BA1X283 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3PXD2BA1X283 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms